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Enregistrement W7133069597

Characterization of anaerobic benzene-degrading cultures

2004· dissertation· W7133069597 sur OpenAlexfundno aff
Anna Christine Ulrich

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2004
Typedissertation
Langue
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésEubacteriumAchromobacterAnaerobic exercisePseudomonasBacteriaEnrichment culture
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dissertation describes several studies of anaerobic benzene degradation by microorganisms and fulfills four objectives. The first and second objectives were to characterize microbial populations in two benzene-degrading consortia (one methanogenic and one nitrate-reducing) on a physiological and molecular level. The shortest doubling times, 8 to 9 days, were observed in nitrate-reducing cultures. The highest substrate concentration utilized, 1000 muM, and maximum absolute rates of benzene degraded, 75 muM/day, were observed in methanogenic cultures. Five Bacterial 16S rRNA sequences, one of which resembled a clone previously found in a sulphate-reducing benzene-degrading culture, were identified in the methanogenic culture. Four Bacterial and no Archaeal 16S rRNA sequences were identified in the nitrate-reducing culture. One clone comprised 70% of the culture and was phylogenetically 93% similar to both Azoarcus and Dechloromonas species. The third objective was to isolate and characterize pure cultures capable of anaerobic benzene biodegradation. Two co-cultures called Dechloromonas co-culture (DCC) and Azoarcus co-culture (ACC) were successfully isolated from a nitrate-reducing enrichment culture. DCC is sim;99% Dechloromonas sp. and sim;1% an unidentified eubacterium clone. ACC is sim;98% Azoarcus sp. and sim;2% Pseudomonas sp. Both co-cultures were capable of anaerobic benzene, toluene and benzoate degradation under nitrate-reducing conditions. The isolated Pseudomonas sp. was capable of aerobic benzene degradation and hydrogen utilization under nitrate-reducing conditions. The isolated unidentified eubacterium clone did not exhibit growth on any of the substrates tested. The Dechloromonas and Azoarcus organisms are responsible for anaerobic benzene degradation. The fourth objective was to identify the key metabolic steps in the anaerobic benzene degradation pathways. 13C6-benzene experiments were conducted with the methanogenic and nitrate-reducing enrichments. Under methanogenic conditions a maximum of 8 muM 13C6-phenol and 3 muM 13C6-benzoate were detected. These results indicate that under methanogenic conditions a pathway where benzene undergoes hydroxylation to phenol and further transformation to benzoate exists. Under nitratereducing conditions a maximum of 90 nM 13C6-toluene, 120 nM 13C6-benzoate and no phenol were detected as intermediates of benzene degradation. This is the first evidence for a pathway where benzene undergoes methylation to toluene and further transformation to benzoate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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