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Enregistrement W7133079260

Pigment Cells Model Lineage Regulation and Cell Clearance in the Planarian Schmidtea mediterranea

2023· dissertation· W7133079260 sur OpenAlexaff
Nicole Rachel Lindsay-Mosher

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlanarianEfferocytosisTurbellariaStem cellCellCompartment (ship)PlanariaFlatwormCellular differentiation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Billions of cells are replaced in adult humans every day, yet many of the mechanisms of cell turnover are still poorly understood. In particular, the clearance of dead cells by engulfment, a processed termed “efferocytosis”, remains mysterious. In this thesis, I investigate cell turnover using the freshwater planarian Schmidtea mediterranea, a model organism that undergoes constant cell turnover as an adult and is capable of regenerating all of its organs and tissues. Using light-induced ablation of pigment cells, I first characterize the pigment lineage as a model for cell clearance. Next, I investigate the molecular mechanisms of efferocytosis in planarians, and find that the highly conserved engulfment receptor CED-1/Draper/MEGF10 is not conserved in planarians. Instead, I demonstrate that a related gene, megf6, and the extracellular matrix component hemicentin both function to restrict the stem cell compartment by maintaining the integrity of the basement membrane. Finally, by tracking planarian pigment cells following light exposure, I demonstrate that apoptotic cell corpses are transported to the gut, where they are engulfed by gut phagocytes and excreted from the animal. The planarian ortholog of the conserved engulfment gene CED-12/ELMO is required for efferocytosis of pigment cells by gut phagocytes. Together, these results provide the first insight into the mechanisms of cell clearance in planarians.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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