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Enregistrement W7133080443

Investigating the role of VSX1 in corneal dystrophies

2006· dissertation· W7133080443 sur OpenAlexfundno aff
S. Mohsen Hosseini

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2006
Typedissertation
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueCorneal surgery and disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPasteur Institute of IranHospital for Sick Children
Mots-clésKeratoconusLocus (genetics)GeneDystrophyMutationTranscription (linguistics)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Posterior polymorphous corneal dystrophy (PPCD) is an endothelial dystrophy mapped to 20p 12-q 12 (PPCD1). Mutations in VSX1, a transcription factor of the disease interval, were found in PPCD and keratoconus patients. However, no change was identified in the family used for mapping the locus. This thesis explores the possible additional mutation mechanisms to clarify the pathogenicity of VSX1 in corneal dystrophies. Six (4 novel) transcript variants of VSX1 were characterized by a 3'RACE assay but did not show any mutations in PPCD1 families. Six cis- regulatory modules were predicted in the vicinity of VSX1 (100 kb) but did not reveal any disease-associated mutations. Semiquantitative real-time RT-PCR detected expression of VSX1 in neonatal human cornea. Recombination events refine the disease interval in the original PPCD1 family from 20 to 16.44 cM. The refined interval contains CHED1 and a recently described PPCD locus for Czech families. Mutation analysis of PPCD1 families did not reveal any mutations in two candidate genes of the new interval.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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