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Enregistrement W7133084617

Transcriptional cooperation by the TGFbeta and Wnt signalling pathways in development and cancer

2007· dissertation· W7133084617 sur OpenAlexfundno aff
Étienne Labbé

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2007
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésWnt signaling pathwaySMADTranscription factorGastrulationSignal transductionXenopusGeneTransforming growth factorBeta-catenin
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Growth factors of Transforming factor beta (TGFbeta) and Wnt signalling pathways are secreted morphogenic factors critical to normal embryonic development in metazoan organisms. In Xenopus frogs, cortical rotation of the fertilized oocyte causes an overlap of signalling determinants of both pathways leading to synergistic induction of genes marking the Spemann organizer, the region that initiates gastrulation and specifies the anterior-to-posterior axis of the embryo. In post-natal organisms, active signalling from both pathways is found in a number of tissues, contributing to their homeostatic maintenance and proper physiology and architecture. While mutations affecting components of both pathways have been extensively documented in malignancies the TGFbeta pathway has generally been regarded as having tumour-suppressive functions, while the aberrant activation of the Wnt pathway is considered oncogenic. The work presented here first delineates the molecular mechanism of transcriptional cooperation between TGFbeta and Wnt. We show that the TGFbeta mediators Smad2, Smad3, and Smad4 physically associate with members of the LEF1/TCF family of DNA-binding transcription factors, proteins that mediate the activation of Wnt target genes via association with beta-catenin. The interaction is mediated by the Smad MH1 and MH2 domains, and the HMG-box DNA-binding domain of LEF1. Physical association of Smads and LEF1/TCFs following stimulation of the TGFbeta and Wnt pathways targets the Xtwin gene promoter, which contains binding sites for both families of proteins, causing synergistic transcriptional activation. Next, we perform a microarray screen that identified putative cooperative target genes of TGFbeta and Wnt3a signalling in mammalian cells. A subset of the genes identified were shown to be overexpressed in tumours from MMTV-Wnt1 mice as well as in intestinal adenomas from MinAPC/+ mice, two models in which the Wnt/beta-catenin pathway is activated. One target, InhibinbetaA, is strongly activated in a synergisitc fashion by TGFbeta and Wnt3a, is highly overexpressed in Wnt and Min tumours/adenomas, is also widely over-expressed in most intestinal tumours as assessed by the use of a Tumour Profiling Array. The expression of InhibinbetaA, along with that of Gpc1, another TGFbeta/Wnt target, was also highly correlated with the expression of Axin2 and cyclinD1, two well-established target of the Wnt/beta-catenin pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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