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Enregistrement W7133095907

An investigation of the endosomal trafficking of the ClC-2 chloride channel

2006· dissertation· W7133095907 sur OpenAlexfundno aff
Sonja Urmilla Dhani

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2006
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversity of TorontoJohns Hopkins UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésEndosomeInternalizationIntracellularRetromerEndocytosisTransport proteinMotor proteinDyneinChloride channelFunction (biology)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The voltage-gated ClC-2 chloride channel has been functionally implicated in several physiological processes. First, ClC-2 knock-out mice are blind, and the males, infertile. Furthermore, a role for modulating neuronal ionic homeostasis has been proposed as mutations in ClC-2 are associated with epilepsy, and ClC-2 has been localized to the GABAergic synaptic locale in hippocampal neurons. Although the functional properties of ClC-2 have been extensively studied, less is known about the proteins and mechanisms that serve to regulate its function. The work presented here has made significant progress towards achieving a better understanding of how the vesicular trafficking of ClC-2 contributes to the modulation of its function. Using a combination of biochemical, physiological and cell biology techniques, we demonstrate that manipulations known to modulate ClC-2 channel function do so, in part, by altering its endosomal trafficking routes. Specifically, Calyculin A, which promotes protein phosphorylation, facilitates the internalization of ClC-2 in a dynamin-dependent manner, and ultimately leads to its proteasomal degradation. This retrograde pathway involves the dynein motor complex, which participates in a functional interaction with ClC-2. Conversely ATP depletion, a condition that promotes protein dephosphorylation, recruits intracellular ClC-2 to the cell surface in a Rab11-dependent pathway. Finally, we have found that ClC-2 is physically associated with the GABA A receptor in vivo. Our investigations suggest an extrasynaptic and possibly intracellular localization for this interaction, and provide the biochemical evidence to support a functional interaction between these two channels. We therefore propose that the endosomal trafficking of ClC-2 may play a significant role in the functional regulation of the GABA A receptor. Collectively, our findings underscore the physiological significance of the endosomal trafficking of ClC-2, and provide the structural framework for future studies aimed to determine the role of ClC-2 in endosomal function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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