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Enregistrement W7133105680

Statistical Computing With Graphics Processing Units

2023· dissertation· W7133105680 sur OpenAlexaboutno aff
Ruoyong Xu

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRandom number generationGraphicsSoftwareGenerator (circuit theory)ComputationSet (abstract data type)Aggregate (composite)Statistical inferenceGaussian
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This thesis consists of two main projects and a third project which is provided in the appendix. The contribution of the first project, is a tool set for parallel random number gen- eration on GPUs in R, namely, the clrng package. This package is currently the only R package that provides facilities for generating random numbers in parallel on a GPU. It enables reproducible research by setting random initial seeds for streams on GPU and CPU. The random number generator in clrng guarantees independent parallel samples even when R is used interactively in an ad-hoc manner, with sessions being interrupted and restored. This package can be easily incorporated in other R packages, allowing developers to develop other types of random number generators or accelerate suitable computations in statistical applications. The contribution of the second project, is a methodology and software for creating profile likelihoods for parameters in Gaussian spatial models with Mat ́ern family of correlation functions, including anisotropic models. This methodology adopts a novel reparametrization for generation of representative points, and is implemented in the software gpuLik, which uses GPUs for parallel profile likelihoods computation. Our work has shown how GPU’s enable likelihood-based inference for Gaussian spatial models without requiring approximations to the variance matrix, even for moderately large datasets. The third project provided in the Appendix is dedicated to evaluating the impact of the COVID-19 pandemic on online public interest in various cancers (breast, colon, lung, prostate, and thyroid). A cross-sectional retrospective study was conducted utilizing Google Trends aggregate anonymous online search data from Canada. Welch’s Two Sample t-tests were performed and Benjamini-Hochberg procedure was used to correct for multiple comparisons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,054
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil0,761

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,054
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0030,007
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0110,005
Science ouverte0,0060,005
Intégrité de la recherche0,0030,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2280,159

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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