Data from: Retracing the response of Rangifer to postglacial climate change in Arctic islands
Notice bibliographique
Résumé
We compiled published datasets of mitochondrial DNA sequences which informed Quaternary population history scenarios. These scenarios were evaluated in a coalescent-based approximate Bayesian computation (ABC) modelling framework (using DIYABC RF) to test hypotheses of postglacial island (re)colonisation and to estimate timings of population divergence and admixture. Population events were compared with modelled paleo-sea ice cover and published ice sheet chronologies. Rangifer tarandus L. play a key role in Arctic ecosystems as the most numerous and widespread large herbivore. Sea ice is vital for maintaining genetic connectivity in Arctic islands, yet the historical role of sea ice in shaping R. tarandus biogeography is unknown. We studied the role of sea ice changes and ice sheet retreat since the last glacial period in the timing of island dispersal. We compiled published datasets of mitochondrial control region sequences that informed population history scenarios, which were evaluated in a coalescent-based approximate Bayesian computation (ABC) modelling framework to test hypotheses of island (re)colonisation and to estimate divergence and admixture. Population events were compared with modelled and proxy-based paleo-sea ice cover and published ice sheet chronologies. Our analysis supports Holocene dispersal onto deglaciated Arctic islands, rather than High Arctic glacial refugia. The degree of population admixture and the effect of sea ice was dependent on regional geography and climate history. North American initial island population divergence occurred as sea ice cover was declining. A lack of strong genetic structure and the occurrence of late Holocene admixture suggest that Canadian Arctic Archipelago populations were somewhat connected by sea ice during the Holocene. The Svalbard, Franz Josef land, and West Greenland colonisations arose through long-distance dispersal. Here, divergence times occurred post-deglaciation but broadly align with subfossil-based colonisation estimates, suggesting dispersal limitation due to sea ice conditions, potentially requiring appropriate ocean currents and sea ice drift directionality and speeds. Our study sheds light on the Late Quaternary (~60 ka - present) history of Arctic island Rangifer and suggests that ice sheet retreat, sea ice, and ocean currents were important in shaping present-day genetic patterns. Regional differences in postglacial dynamics suggest that dispersal during contemporary climate change may vary regionally and depend upon diminishing connectivity provided by sea ice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».