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Enregistrement W7133278120

Réponse des Sciences : Évaluations de l’état du saumon du Pacifique selon l’approche rapide

2024· other· fr· W7133278120 sur OpenAlexaboutno aff
Pêches et Océans Canada, Fisheries and Oceans Canada

Notice bibliographique

RevueFederal Open Science Repository of Canada / Le Dépôt fédéral de science ouverte du Canada · 2024
Typeother
Languefr
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationIle de francePhytopharmacology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Le suivi régulier de l’état des stocks et de la répartition de la biodiversité du saumon est de plus en plus important dans un contexte de changement climatique. Le déclin généralisé de l’abondance du saumon du Pacifique canadien a été lié au changement climatique mondial et à d’autres facteurs comme la détérioration des habitats, l’augmentation des maladies du poisson et les espèces envahissantes (Grant et al. 2019). Pour suivre l’évolution de la biodiversité du saumon, nous présentons une méthode d’évaluation rapide de l’état des stocks de saumon du Pacifique en vertu de la Politique concernant le saumon sauvage (PSS). Cette méthode peut attribuer un état rouge, ambre ou vert avec un niveau de confiance élevé, moyen ou faible aux unités de conservation (UC) du saumon avec les données applicables. La diversité adaptative du saumon du Pacifique se manifeste à différentes échelles, notamment au niveau de l’espèce, de l’UC, de la population et du dème. La PSS détermine la diversité à l’échelle des UC comme des unités fondamentales qui ne peuvent être recolonisées si elles sont perdues (MPO 2005; Holtby et Ciruna 2007; Wade et al. 2019). La PSS de Pêches et Océans Canada (MPO) couvre cinq espèces de saumon du Pacifique : le saumon rouge (Oncorhynchus nerka), le saumon chinook (O. tshawytscha), le saumon coho (O. kisutch), le saumon rose (O. gorbuscha) et le saumon kéta (O. keta). Le MPO a le pouvoir de gérer ces espèces de saumon en vertu de la Loi sur les pêches (2019). La truite arc-en-ciel (O. mykiss) est gérée à l’échelle provinciale et, par conséquent, n’est pas incluse dans les évaluations rapides de l’état des stocks en vertu de la PSS. La Direction des sciences du MPO a demandé au Secrétariat canadien des avis scientifiques (SCAS) d’examiner l’approche d’évaluation rapide de l’état des stocks de la PSS pour appuyer l’évaluation de l’état des unités de gestion des stocks (UGS) de saumon du Pacifique par rapport à leurs points de référence limites (PRL). Une UGS est un groupe d’une ou plusieurs unités de conservation (UC) qui sont gérées ensemble dans le but d’atteindre un état commun. Le PRL correspond à l’état d’un stock au-dessous duquel il risque de subir de graves dommages, selon les critères biologiques établis par la Direction des sciences du MPO dans le cadre d’un examen par les pairs. Une UGS en deçà de son PRL déclenche un plan de rétablissement. Un processus récent du SCAS a recommandé que les PRL des UGS soient définis sous forme de pourcentage, l’objectif étant que 100 % de toutes les UC de l’UGS soient au-dessus de la zone d’état rouge de la PSS (MPO 2023; Holt et al. 2023a, 2023b). Une UGS se retrouve sous le PRL si une ou plusieurs des UC de cette UGS se trouvent dans la zone d’état rouge de la PSS. La méthode d’évaluation rapide de la PSS a été recommandée pour évaluer l’état par rapport au PRL (MPO 2023a; Holt et al. 2023a). Par la suite, dans le cadre du processus du SCAS présenté dans le présent rapport, une prochaine étape recommandée est la vérification des résultats de l’évaluation selon l’approche rapide de la PSS de chaque UC et la détermination de l’état du PRL par des experts dans le cadre d’un processus structuré. Les évaluations de l’état intégrées existantes en vertu de la PSS fournissent une approche de base pour suivre la situation annuelle de l’UC du saumon. Cette approche fait appel à un processus décisionnel d’experts pour combiner les états des mesures individuelles en vertu de la PSS et les renseignements connexes supplémentaires en un seul état intégré. Cependant, la méthode d’évaluation intégrée de l’état des stocks de la PSS ne nous permet de suivre que partiellement l’état annuel de l’UC, puisqu’elle exige beaucoup de temps et de main-d’œuvre, et que, par conséquent, elle n’a été achevée que pour 11 % des 377 UC actuelles, et est dépassée depuis 5 à 10 ans. Afin d’accroître le nombre d’UC évaluées et de fournir des mises à jour annuelles sur l’état des UC, le présent document présente une nouvelle méthode d’évaluation rapide en vertu de la PSS qui se rapproche du processus décisionnel expert utilisé dans les évaluations intégrées de l’état des stocks. Les états rapides annuels de la PSS sont estimés à l’aide d’un algorithme mis en œuvre avec un code informatique pour les UC de la Colombie-Britannique (C.-B.) et du Yukon avec les données applicables. La méthode d’évaluation rapide de la PSS offre une couverture plus complète des états de l’ensemble des UC. Pour augmenter le nombre d’UC évaluées, il faudra consulter des experts en évaluation des stocks pour sélectionner les sites de dénombrement des échappées et les années appropriées, et pour traiter les données, notamment en comblant les lacunes, le cas échéant. Les experts travailleraient de manière itérative pour explorer les spécifications à utiliser avec l’algorithme d’état rapide de la PSS, comme l’identification des paramètres d’état rapide de la PSS applicables à ces données, et l’examen des états rapides de la PSS générés par l’algorithme afin de finaliser l’approche pour leurs UC. Il est recommandé d’établir une stratégie de gouvernance pour ce travail, y compris l’identification des rôles et des responsabilités, afin d’assurer l’inclusion de nouvelles UC et des mises à jour annuelles pour toutes les UC. La méthode d’évaluation rapide de la PSS est intégrée au système d’analyse de l’état du saumon du Pacifique du MPO. L’Explorateur de l’état des saumons du MPO est un outil interactif de visualisation des données conçu spécialement pour les experts afin de soutenir l’exploration scientifique et de les aider à intégrer la science dans les processus décisionnels. Les experts sont ceux qui ont une expertise sur le saumon du Pacifique, y compris les biologistes de l’évaluation des stocks, les experts techniques autochtones, les chercheurs scientifiques, les biologistes de l’habitat, de la récolte et de la gestion des écloseries, etc. Les objectifs de la présente réponse des Sciences sont les suivants : 1. Résumer les méthodes, les résultats et les conclusions de l’approche d’évaluation rapide de la PSS. L’élaboration de cette approche comprenait trois éléments clés : a. une évaluation de la performance des algorithmes d’évaluation rapide des candidats par rapport aux évaluations intégrées existantes de la PSS examinées par le SCAS; b. une évaluation de l’application des algorithmes rapides de l’état aux années et aux UC qui n’ont pas actuellement d’évaluations intégrées de la PSS; c. une mesure de la confiance dans les résultats des évaluations rapides de l’état. 2. Documenter les processus d’examen qui ont eu lieu en vue d’élaborer l’algorithme d’évaluation rapide 3. Fournir un avis sur les prochaines étapes et les travaux futurs Le présent rapport d’intervention scientifique découle de l’examen par les pairs régional du 18 novembre 2022 sur les approximations rapides de l'état du saumon du Pacifique dérivées d'évaluations d'experts intégrées dans le cadre de la Politique concernant le saumon sauvage de Pêches et Océans Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,040
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,061
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,210

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0400,061
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

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