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Enregistrement W7133469821

An investigation of the molecular and structural properties of the mutable collagenous tissue in a European sea cucumber

2023· article· en· W7133469821 sur OpenAlexaff
Némo Lemaire, Nathalie Singh, Amy Hui‐Mei Lin, Ruddy Wattiez, Jérôme Delroisse, Matthew Harrington, Patrick Flammang

Notice bibliographique

RevueORBi UMONS · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEchinoderm biology and ecology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDermisConnective tissueExtracellular matrixSea cucumberFibrilExtracellularMolecular modelType I collagen
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mutable collagenous tissue (MCT) found in echinoderms, including sea cucumbers, is a unique connective tissue that can rapidly change its mechanical properties in response to certain stimuli. This tissue is constantly switching between different stiffness states! In sea cucumbers, the tissue properties are modulated by the release of molecular factors in the extracellular matrix, leading to the formation of transient cross-bridges between collagen fibrils. Surprisingly, despite this unique ability, there have been relatively few studies on the molecular and structural characteristics of MCT compared to other collagen-based connective tissues. The present project aims to explore the molecular composition and the structure of the MCT constituting the dermis of the European sea cucumber Holothuria forskali. Proteomic analyses coupled to transcriptomics allowed to investigate the specific molecular components of the MCT. Obtained results showed an interesting combination of alpha 1, 2 and 5 chains in purified collagen fibrils. Furthermore, Raman and ATR-FTIR spectroscopy showed bands consistent with type I collagen, corroborating SEM observations of the fibrils. Additionally, characterization of the collagen structure and organization in the dermis of H. forskali was performed using polarized light microscopy and X-ray diffraction in comparaison with another species, Cucumaria frondosa. Preliminary data seem to indicate a species-specific preferential alignment of collagen in holothuroids. Understanding the molecular and structural properties of MCT could have potential applications in the medical and engineering fields as an inspiration for memory-shaped material with reversible viscoelastic state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil0,687

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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