Regional variation in community bacteremia pathogens in British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background: Bloodstream infections are a significant cause of community morbidity and mortality, and their microbiological patterns can vary regionally. In British Columbia, the Lower Mainland and Vancouver Island represent two major population centres with distinct demographic and exposure characteristics. Analysis of community blood culture data provides an opportunity to identify geographic differences in bloodstream pathogens and monitor regional antimicrobial resistance trends over time. Methods: Blood culture data collected by LifeLabs British Columbia from 2020 to 2024 were analyzed, encompassing 744 community isolates: 620 from the Lower Mainland and 124 from Vancouver Island. Organisms were identified, and antimicrobial susceptibility results were compared between the two regions to assess regional variation in bloodstream infection patterns. Results: Of all isolates, 62% were Gram-positive and 37% were Gram-negative; yeast accounted for 1% of isolates and were not analyzed further. In the Lower Mainland, Salmonella species (41% of gram-negative isolates) and Escherichia coli (E. coli) (32% of Gram-negative isolates) were the predominant Gram-negative organisms, whereas E. coli was most common on Vancouver Island (35% of Gram-negative isolates). Overall, Staphylococcus aureus (11%) and viridans group Streptococcus (22%) were the most frequently isolated Gram-positive organisms. Salmonella species and E. coli demonstrated reduced ciprofloxacin susceptibility (0% and 60%, respectively), while Salmonella remained universally susceptible to ceftriaxone (100%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (100%). Conclusion: This analysis provides region-specific surveillance data describing the distribution and antimicrobial susceptibility of community bloodstream pathogens in British Columbia. The identification of Salmonella predominance in the Lower Mainland and reduced ciprofloxacin susceptibility among E. coli highlights the importance of ongoing provincial surveillance. These findings contribute to a better understanding of regional epidemiology and inform infection control and antimicrobial resistance monitoring initiatives in community health settings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».