MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7135055834 · doi:10.5376/ijmec.2025.15.0015

Phylogenetic Reconstruction and Genomic Adaptive Evolution Analysis of Channa spp.

2025· article· W7135055834 sur OpenAlexvenueno aff
Manman Li

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Ecology and Conservation · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogenetic treePhylogeneticsAdaptation (eye)Convergent evolutionGeneMolecular evolutionGenomicsGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study reviews recent advances in the phylogeny and genomic adaptive evolution of the genus Channa, including information on species diversity and taxonomic status, phylogenetic reconstruction, geographic evolutionary history inferred from molecular clocks, and genome-based analyses of hypoxic adaptation, immune mechanisms, and behavioral adaptations. The study found that Channa can be divided into several major clades, whose biogeographic distributions are closely correlated with geological events. Genomic analyses revealed the genetic basis of hypoxic respiration, immune defense, and behavioral regulation in Channa species, including adaptive changes in genes involved in the hemoglobin and hypoxia-inducible factor (HIF) pathways, expansion of the innate immune receptor gene family, and differential evolutionary rates of genes related to neural development and circadian rhythms. Furthermore, genomic comparisons of Channa ecotypes (highland/lowland, and river/swamp environments) revealed convergent and divergent patterns of adaptive mutations. This study contributes to the construction of an evolutionary framework encompassing the "gene-environment-phenotype" perspective, providing new insights into the evolutionary history and environmental adaptation mechanisms of the genus Snakehead, and offering insights for the conservation and management of these species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Molecular Ecology and ConservationMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207