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Enregistrement W7135056605 · doi:10.1183/13993003/erj.38.suppl_55.p903

Clinical validity of blood and urinary desmosine as biomarkers for chronic obstructive pulmonary disease

2011· article· en· W7135056605 sur OpenAlexaff
Jeffrey Huang, Rekha Chaudhuri, Alun Barton, Jeffrey D. Brady, Christal Grierson, Osama Albarbarawi, Petra Rauchhaus, Christopher J. Weir, Martina C Messow, Charles McSharry, Giora Feuerstein, Somnath Mukhopadyhay, Colin Palmer, Douglas K. Miller, Neil Thomson

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDesmosineCOPDExacerbationElastinBiomarkerProteinuriaUrinary system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Although the elevation of degraded elastin products in patients with COPD has been reported for many years, its clinical validity and utility remain uncertain due to technical difficulties, small study cohorts and unknown relationship between exacerbation and elastin degradation. Aims and objectives: To determine the validity of urinary and blood total desmosine/isodesmosine (uDES and bDES) as disease phenotyping biomarkers for COPD and to evaluate their relationship to exacerbation status. Methods: uDES and bDES were measured using validated isotopic dilution LC-MS/MS methods. Results: Two cohorts consisting of a total of 390 subjects including the following groups: healthy volunteers, stable asthma, stable COPD and COPD during an exacerbation were investigated. Compared to healthy non-smokers, we found increased bDES levels in patients with COPD regardless of exacerbation status (p<0.001, ANOVA), but no differences in patients with asthma or healthy smokers. A similar observation was found for uDES except that the elevation of uDES levels was associated with an exacerbation in COPD patients (12±5 vs. 20±12 ng/mg creatinine for stable and exacerbation, respectively, p<0.01, t test). Such an increase in COPD patients during an exacerbation was closely related to inflammation associated proteinuria (p<0.001, Spearman correlation). Approximately 40% of patients showed an “accelerated elastin degradation” phenotype based on their bDES levels in both stable COPD and COPD during an exacerbation. Conclusions: Our results strongly suggest that bDES is a valid biomarker for phenotyping “accelerated elastin degradation” subtype in COPD whilst uDES links to exacerbation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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Résumé présentoui

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