Truncated mucin type O-Glycans in Epithelial Cancers: Central Drivers or Blind Passengers?
Notice bibliographique
Résumé
Aberrant expression of truncated mucin type O-glycans is a known hallmark of epithelial cancers and represents an attractive drug target due to the relative low expression of these glycoforms in normal human tissue. However, the underlying mechanisms resulting in truncation of O-glycans as well as their potential roles in cancer development has yet to be fully understood. To investigate O-glycan influence on tissue formation and cancer, we created a library of human, primary keratinocytes with genetically engineered deficiencies in O-glycosylation capacity. Using an organotypic 3D model of human skin, we show that induction of truncated O-glycans instigates delayed differentiation and change in tissue architecture in the basal layers. Furthermore, our genetically engineered cell-lines provide evidence that truncated O-glycans result in increased proliferation. To map the O-glycan landscape of human cancers in vivo, we conducted a systematic analysis of T-, Tn- and STn-antigen expression in several tissue samples from a range of epithelial cancers using immunohistochemistry. In order to probe the mechanisms underlying O-glycan truncation, we employed a strategy combining whole-genome, CRISPR-Cas mediated loss-of-function screening and flow cytometry sorting based on glycan-specific antibodies. This strategy yields a deeper understanding of the mutagenic landscape potentially resulting in O-glycan truncation in human cells (and potentially cancers), extending beyond perturbations of genes already known to results in O-glycan truncation, i.e. COSMC and C1GALT1. In conclusion, our work indicates potential roles for truncated O-glycans in tissue homeostasis, provides a mapping of O-glycoforms in human cancers and yields new insights into mechanisms underlying O-glycan truncation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».