Supplemental data for: Phenotypic differentiation of Streptococcus thermophilus and Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus isolates found in yogurt starter cultures
Notice bibliographique
Résumé
The mutualistic relationship between Streptococcus thermophilus (S. thermophilus) and L. del-brueckii subsp. bulgaricus (L. bulgaricus) is responsible for milk coagulation, gel formation, and the flavour of yogurt. Under set-style yogurt processing conditions, the performance of a mixed culture composed of these species depends on key technological parameters such as the capacity for acidi-fication and proteolytic activity. This study aimed to determine the extent of phenotypic diversity by comparing the key traits of acidification and proteolytic activity among isolates found in yo-gurt starter cultures. Seventy-two isolates from three industrial starter cultures were ranked by either their fast or slow acidification activity (time to reach pH 4.6, 16 h), proteolytic activity, cell envelope proteinase (CEP) activity, redox potential and titratable acidity. The integration of mul-tiple phenotype measures by hierarchical clustering and non-metric dimensional scaling (NMDS) clustered groups of isolates by multifactor similarity. A significant difference (p-value < 0.05) was observed between the clusters regarding redox potential and the proteolytic activity of both S. thermophilus and L. bulgaricus. The integration of multiple phenotypes points to the diversification that may have occurred over repeated culturing of yogurt starter bacteria. The phenotypic diver-sity may explain the divergence in starter performance and be used to refine the formulation of new starter cultures. Future work will investigate the correlation between the activity of specific enzymes based on the phenotype to explain the separation between the fast and slow acidification of isolates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,637 | 0,128 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».