The evolutionary history of Great Horned Owls (Bubo virginianus) at multiple scales
Notice bibliographique
Résumé
This dissertation investigates how different mechanisms, such as biogeographic barriers, historical isolation and environmental conditions cause and maintain population structure at multiple geographic scales. I used genomic data to investigate the evolutionary history of Bubo virginianus (Great Horned Owl) at three scales: range wide, throughout the United States and Canada, and B. virginianus and their lice throughout a population and plumage contact zone from Illinois to Colorado. I first assess disputed species boundaries in B. virginianus at the range wide scale using probe capture and mitochondrial data and find support for a deep species level split between populations north (B. virginianus) and south (B. v. magellanicus) of the Marañón Valley. I also identified shallow population structure in North America despite high amounts of described phenotypic variation. Using reduced-representation genomic data, I investigated this pattern in more detail and found that despite many described subspecies, only three shallowly diverged populations existed in the United States and Canada that likely formed due to isolation during the Pleistocene glacial cycles. Finally, I used reduced representation and genomic sequencing to investigate how parasitic feather lice (Strigiphilus syrnii) are evolving with their hosts across a secondary contact zone between two of the three identified populations. I identified that the lice are surprisingly not as limited by host connectivity as the literature suggests they should be. Their population structure is more strongly influenced by environmental variation such as humidity and temperature than host characteristics or geographic distance. At each level, I identified different causes of population structure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».