DNA metabarcoding data from Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) deployed around Calvert Island British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) provide a standardized framework to monitor marine biodiversity. Currently, over 1,600 ARMS have been deployed globally across a number of organisations and geographical regions. Most of these deployments are related to coral reef systems, and relatively few deployments have been associated with temperate reefs or kelp forests. This data package contains links to genomic resources obtained from our use of ARMS to test whether the presence of canopy-forming kelps would influence rates of recruitment of invertebrates and seaweeds on temperate near-shore rocky reefs. Data collection was carried out at 12 locations in Queen Charlotte Sound, British Columbia. Of these sites, four were kelp beds dominated by Nereocystis luetkeana, four were kelp beds dominated by Macrocystis pyrifera, and four were considered to be urchin barrens. One ARMS unit was deployed at each site. The first deployment lasted from autumn 2016 to summer 2017 (10-11 months), the second deployment lasted from autumn 2017 to autumn 2020 (36 months). For each deployment, all methods used for assembly, collection, photography, and biological sampling were carried out following the protocol described by the Global ARMS Program (Smithsonian Institution: https://naturalhistory.si.edu/research/global-arms-program).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,011 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,013 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».