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Enregistrement W7161483011 · doi:10.5281/zenodo.20253675

Alpheus pacificus Dana 1852, sensu lato

2016· article· W7161483011 sur OpenAlexaboutno aff
Arthur Anker, Sammy De Grave

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2016
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSensuIntertidal zoneTaxonSpecies complexDNA barcodingBanner

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alpheus pacificus Dana, 1852 sensu lato Alpheus pacificus Dana, 1852a: 21; Dana, 1852b: 544; De Man, 1911: 427; Tiwari, 1965: 315; Banner & Banner, 1966a: 143; Banner & Banner, 1978: 227; Banner & Banner, 1982: 217; Banner & Banner, 1985: 26; Chace, 1988: 45. (?) Alpheus gracilidigitus Miers, 1884: 287. CMBS material. None. Additional material. Strait of Singapore. 1 male, 1 ov. female, ZRC 2008.0634, Siglap, no further data, VI.1933; 1 male, ZRC 2000.1443, East Coast, leg. K.L. Yeo, 08 May 2000; 1 male, ZRC 2014.0654, Singapore sta. JL04 D206, VI.2004, no further data. Distribution. Indo-Pacific, from the Red Sea and South Africa to Japan, Korea, Indonesia, Australia, Hawaii, French Polynesia, Rapa Nui, Clipperton, Galapagos, and Mexico to Panama. Previous records from Singapore. None. Ecology. Rocky shores and mixed sand-rock-rubble bottoms in shallow water, usually under rocks or in dead corals, apparently preferring well-washed clean sands of beaches exposed to wave action; most common in intertidal and shallow subtidal, sometimes down to 20 m. Remarks. Variation in some morphological features and colour patterns in material identifiable as Alpheus pacificus (Banner & Banner, 1982; A. Anker, pers. obs.) suggest that this taxon is a complex of several cryptic species. Preliminary analyses of the barcoding part of the COI gene showed that A. pacificus is composed of three genetically well-defined clades, each most likely corresponding to a distinct species (A. Anker, in study). Thus, A. pacificus will need a careful taxonomic revision, with reappraisal of the status of A. gracilidigitus Miers, 1884, currently a junior synonym. For the time being, all Indo-Pacific material has to be identified as A. pacificus sensu lato. The Singaporean material of A. pacificus was collected in the intertidal areas of Siglap and East Coast in the early 2000s. The species has not been collected during the more recent intertidal surveys (CMBS 2012–2014), although one ovigerous female with regenerated chelipeds was seen (but not collected) at Labrador Beach in March 2014 (A. Anker, pers. obs.). It seems that A. pacificus is becoming rare in Singapore due to its preference for well-washed and clean sand-rock bottoms, which are now increasingly being replaced by silt and fine sand.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0300,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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