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Enregistrement W7161769632 · doi:10.82308/42520

Iron acquisition in the adult filarial nematode «Brugia malayi» and the effect of ivermectin on heme binding proteins and the transcriptome

2016· dissertation· en· W7161769632 sur OpenAlexaboutno aff
Cristina Ballesteros

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic Diseases Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBrugia malayiOnchocerca volvulusLymphatic filariasisIvermectinTranscriptomeBrugia pahangiOnchocerciasisNematodeFilariasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human filarial nematode infections caused by Wucheria bancrofti, Brugia malayi and Brugia timori can lead to lymphatic filariasis (LF), and those due to Onchocerca volvulus can lead to onchocerciasis or river blindness, affecting millions of people in tropical and sub-tropical regions. Brugia malayi has been an excellent model to study human filarial diseases, in particular by employing culture systems, the impact of which on the parasites is unknown. One of our objectives was to evaluate changes in gene expression due to in vitro cultivation of Brugia malayi, as an index of adaptation to removal from the host. We examined the global transcriptome of this parasite by Illumina sequencing technology from the time the parasites were extracted from jirds in Georgia (USA), shipped to Montreal (Canada), and after maintenance for up to 5 days in culture. It was important to assess the effects of culture on the parasite prior to measuring the effects of exposure to drugs such as ivermectin. Ivermectin is the drug of choice for mass drug administration for the control and elimination of onchocerciasis, and for lymphatic filariasis in areas where the diseases are co-endemic. Ivermectin exposure in vivo results in an initial dramatic drop in the levels of circulating or dermal microfilariae, followed by long-term suppression of reproduction. The mechanisms involved in this long-term sterilization are not understood. The main objective of my work was to study the in vitro effects of ivermectin on adult female B. malayi at the proteomic and transcriptome levels using LC/MS/MS and Illumina Sequencing technology. We hypothesized that ivermectin causes paralysis of pharyngeal pumping in these parasites, an effect that would prevent worms from acquiring essential nutrients such as iron-containing proteins (i.e., transferrin). Iron deprivation would have down-stream effects on the biosynthesis of heme by the symbiotic Wolbachia bacteria, which is crucial for reproduction and ATP synthesis as well as other important biological functions. This work led to the identification of genes and heme-binding proteins involved in reproduction and in particular meiosis, which were dysregulated in worms exposed to ivermectin compared to untreated worms. We also established that an iron transporter is expressed in the intestine of B. malayi and showed that this Divalent Metal Transporter 1 (DMT1) can function as an iron transporter in an iron-transport deficient strain of yeast, Saccharomyces cerevisiae. That this transporter is expressed in the intestine of filariid nematodes suggests that the gut is functional and supports the hypothesis that the long-term effects of ivermectin on filarial reproduction could be explained, at least in part, by iron deprivation due to paralysis of pharyngeal pumping.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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