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Enregistrement W7161832218 · doi:10.82308/7935

Novel genetic and molecular regulation of HDL metabolism

2013· dissertation· en· W7161832218 sur OpenAlexaboutno aff
Iulia Iatan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes, Cardiovascular Risks, and Lipoproteins
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationGenetic inheritanceGenetic variabilityCoronary heart disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La maladie coronarienne athérosclérotique (MCAS) est la principale cause de mortalité et de morbidité à l'échelle mondiale. Un niveau bas des lipoprotéines de cholestérol de haute densité (HDL-C) représente un facteur de risque majeur pour la MCAS et est influencé par une combinaison des facteurs génétiques et environnementaux. Dans cette thèse, nous avons abordé la régulation génétique des HDL-C grâce à l'identification et la caractérisation de nouveaux gènes candidats, et de mécanismes moléculaires liés à la biogenèse des HDL, dans l'espoir de mieux élucider la complexité du métabolisme des HDL.En premier, nous avons examiné si la variation au niveau du locus du gène proprotéine convertase PCSK5 peut affecter les niveaux de HDL-C. Grâce aux analyses de ségrégation familiale et aux études d'association génétique dans une population canadienne-française et chez des familles finlandaises (nTotal=883) avec un niveau de HDL-C bas, nous avons constaté une large corrélation régionale entre les variations polymorphiques (SNPs) de PCSK5 et HDL-C. Ceci suggère que la variabilité génétique au niveau du locus PCSK5 réglemente le HDL-C, éventuellement par le biais de l'inactivation de la lipase endothéliale, une enzyme clé dans la modulation des niveaux plasmatiques de HDL-C. Deuxièmement, pour rechercher des variants de fréquence rare qui sont responsables d'un bas niveau de HDL-C, nous avons utilisé la technique du séquençage de l'exome dans une famille multi-générationnelle canadienne-française (n=75) avec un HDL-C<5e percentile spécifique (âge-sexe). Grâce à cette approche, nous avons identifié une combinaison complexe de deux variants non-synonymes dans le transporteur ABCA1 et dans le gène de la lipoprotéine lipase provoquant un taux faible de HDL-C. Ces résultats soulignent la nécessité du séquençage de l'exome des traits lipidiques complexes dans les cas familiaux inexpliqués. Troisièmement, nous avons caractérisé un nouveau gène impliqué dans la régulation du HDL-C. Nous avons examiné le rôle de WWOX dans le métabolisme du HDL en utilisant des études fonctionnelles in vivo avec des souris Wwox total knock-out (KO) et des souris Wwox KO spécifiques au foie, une technologie des puces à ADN et du reséquençage dans des familles canadiennes-françaises déficientes en HDL. Nous avons démontré que l'effet de WWOX sur le métabolisme des lipoprotéines implique plusieurs mécanismes, y compris l'homéostasie du cholestérol, les voies de régulation à travers l'ApoA-I et l'ABCA1 et le métabolisme d'acides gras/triglycérides. Quatrièmement, nous voulions élucider le mécanisme de formation du HDL naissant. Plus précisément, nous avons étudié la lipidation de l'ApoA-I et son interaction avec des sites constitués de microdomaines ABCA1/phosphatidylcholine (PtdC) que nous avons appelés « site de liaison de grande capacité (HCBS) ». En utilisant un gradient de densité de sucrose, nous avons observé que l'ABCA1 et le HCBS sont localisés dans des domaines membranaires solubles aux détergents et que l'ApoA-I désorbe sélectivement la PtdC de ces domaines ainsi créant un environnement optimal pour la formation des molécules naissantes de HDL et la libération de cholestérol.Collectivement, ce travail a élargi notre compréhension des sciences moléculaires et génétiques du métabolisme du HDL. Il a mis en lumière de nouveaux gènes impliqués dans la régulation des niveaux de HDL-C, soulignant la nécessité d'utiliser plusieurs approches intégratives génétiques pour identifier les causes des variants communs et rares conférant une susceptibilité à un faible taux de HDL-C. Ces résultats ont également contribué à élucider le mécanisme de biogenèse du HDL naissant. Ainsi, cette thèse a combiné des stratégies génétiques et biochimiques pour fournir une meilleure compréhension de la complexité du métabolisme des HDL et du transport du cholestérol cellulaire, qui pourrait ainsi conduire à l'élaboration des nouvelles cibles thérapeutiques pour la MCAS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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