Expression and proteomic analysis of KlFlA/25B in hereditary sensory and autonomic neuropathies type ll
Notice bibliographique
Résumé
Hereditary sensory and autonomic neuropathies (HSANs) form a group of rare disorders that are characterized by variable sensory and autonomic dysfunctions. HSAN type II (HSAN-II) is a particularly debilitating subtype in which recurrent injuries lead to ulceration, infection, amputation, and death. Despite the significant suffering this disease inflicts, no treatment can yet be offered and much remains to be understood about the pathology underlying HSAN-II. The first cluster of HSAN-II cases was reported in eastern Canada, with half the cases representing patients of French-Canadian descent. This project focuses specifically on answering fundamental questions regarding the molecular pathophysiology of HSAN-II, though the findings could have an important impact on our understanding both of other neuropathies and of normal nerve cell functioning.Recently the identification of deleterious variations in two genes provided key insights about the genetic architecture and elements underlying HSAN-II. The team of Dr. Guy Rouleau reported truncating mutations in a nervous-tissue-specific exon (HSN2 exon) of the WNK1 gene (lysine deficient protein kinase 1). The WNK1 isoform containing the alternatively spliced HSN2 exon was termed the WNK1/HSN2 isoform, and was found to directly interact with a particular isoform of another HSAN-II causative gene, KIF1A. The HSAN-II-causing KIF1A isoform is named KIF1A/25B as disease-causing mutations were exclusively found in the alternatively spliced exon "25B". This study focuses on assessing the function of the protein domain encoded by exon 25B through a profiling of its interacting partners; specifically focusing on KIF1A/25B implication in axonal trafficking and slightly investigating the expression profile of KIF1A/25B isoform.Here, we identified a list of protein interactors of KIF1A/25B through co-immunoprecipitation (co-IP) followed by mass spectrometry. We confirmed KIF1A-SYT11 interaction via co-IP; however, we were unable to confirm that this interaction is unique to exon 25B. SYT11-KIF1A interaction could suggests that KIF1A is a transit system through which SYT11 traffics within the cells and locates at axonal terminal where it plays a role in establishing balanced endo-exocytosis and sustained neurotransmission. Moreover, we found that KIF1A/25B is mainly present in nervous tissue and absent in non-nervous tissues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».