Investigating hepatitis C and substance abuse risk factors for chronic kidney disease among HIV-infected individuals in the era of advanced antiretroviral therapy
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : À l'époque de la thérapie antirétrovirale avancée, les comorbidités associées au vieillissement sont devenues une préoccupation majeure pour la santé chez les personnes infectées par le VIH. Plusieurs facteurs de risque de maladie rénale chronique (MRC) sont présents chez les personnes vivant avec le VIH, y compris la co-infection par le virus de l'hépatite C (VHC) et la toxicomanie soutenue, et en comprendre l'étiologie est difficile. Objectifs : L'objectif global de cette thèse était d'évaluer le risque de déclin de la fonction rénale et la MRC associés à la co-infection de l'hépatite C et du VIH, et de tester l'hypothèse selon laquelle la toxicomanie continue peut expliquer une partie de l'association observée. Plus précisément, mes objectifs étaient les suivants:1.Décrire l'incidence de la MRC chez les Canadiens infectés par le VIH qui initient un traitement antirétroviral et investiguer la présence d'une association entre la co-infection par le VHC et la progression de la MRC.2.Décrire la prévalence de la consommation de cocaïne chez les canadiens co-infectés par le VIH-VHC et investiguer la présence d'une association entre l'abus de cocaïne et l'insuffisance rénale persistante.3.Décrire les taux annuels de variation de la fonction rénale entre les canadiens co-infectés qui ont développé une réponse virologique soutenue (RVS) au traitement du VHC et ceux qui sont infectés chroniquement.Méthodes et résultats : L'insuffisance rénale chronique (IRC) et la MRC ont été définies par des mesures consécutives du taux de filtration glomérulaire estimé (TFGE), obtenues à au moins trois mois d'intervalle, de ≤ 70 et ≤ 60 mL/min/ 1.73m2, respectivement. Co-infection par le VHC et MRC (objectif 1) : Après ajustement pour les facteurs de risque traditionnels et liés au VIH, la co-infection du VHC a été associée à un risque presque deux fois plus élevé de MRC. Cette association n'a pas été modifiée par l'usage de drogues injectables antécédentes. Le sexe féminin, l'âge croissant, les charges virales plus élevées du VIH et les expositions cumulatives au ténofovir et au lopinavir étaient également associés à la MRC.Cocaïne et insuffisance rénale (objectif 2) : Dans la cohorte transversale, après ajustement pour les facteurs de risque importants de la maladie rénale, un antécédente d'injection de cocaïne était associé à un risque deux fois plus élevé d’IRC. Dans la cohorte de suivi, les utilisateurs qui ont injecté ≥ 3 jours / semaine avaient le plus grand risque d'IRC. L'exposition cumulative à l'injection de cocaïne pendant ≥ 75% du temps de suivi de l'étude a également été associée à l’IRC. La réplication virale chronique du VHC n'était pas associée à l’IRC dans tous les modèles.La RVS et le déclin de la fonction rénale (objectif 3) : L'échantillonnage par densité d'incidence avec des scores de propension temporelle a été utilisé pour apparier chaque participant qui a atteint la RVS avec deux participants infectés chroniquement à la date de la RVS. L’appariement avec remplacement utilisant une approche caliper-free nearest-neighbor a été utilisé. Il n'y a pas eu de différence appréciable dans le taux annuel de déclin de TFGE entre les deux groupes. L'injection de cocaïne est restée le principal facteur modifiable du déclin de TFGE chez les patients infectés par le VIH qui ont atteint une RVS.Conclusions : La co-infection du VHC a été associée à la MRC chez les canadiens infectés par le VIH. Cependant, après avoir pris en compte l’utilisation de la cocaïne, la réplication virale active du VHC n'a pas été associée aux premiers stades de la maladie rénale mesurée par TFGE. En outre, l'éradication de l'infection chronique de VHC par un traitement efficace n’a pas ralenti le déclin de la fonction rénale. Dans l'ensemble, ces résultats suggèrent que l'abus de substances, en particulier l'utilisation de la cocaïne, peut expliquer certaines des comorbidités extra-hépatiques associées au VHC, incluant la MRC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».