A 3-Dimensional co-culture model of Inflammatory Bowel Disease for therapy screening
Notice bibliographique
Résumé
La maladie inflammatoire chronique de l’intestine (MICI) est un trouble intestinal qui affecte la survie et la qualité de vie des patients. Étonnamment, le Canada a l'une des prévalences les plus élevées de maladies inflammatoires de l'intestin au monde, ce qui entraîne un lourd fardeau économique. Bien qu'il existe des options de traitement classiques et des thérapies plus récentes, nous ne savons pas à l'avance quel agent thérapeutique est approprié pour chaque patient. De plus, certains patients ne répondent pas au traitement existant, ce qui indique un besoin de thérapies améliorées et de médecine personnalisée. Il existe des études utilisant des modèles animaux ou des modèles de culture à 2 dimensions, mais ces outils de recherche ont des limites et ne récapitulent pas la maladie humaine. Par conséquent, des modèles plus pertinents sur le plan clinique sont plus appropriés pour les études mécanistes et le criblage de nouvelles options thérapeutiques. Dans cette étude, nous avons généré un système de co-culture tridimensionnelle, comprenant la lignée cellulaire épithéliale intestinale HT-29 et la lignée cellulaire de fibroblastes IRM-90, ensemencées dans de l'hydrogel d'alginate-gélatine. Notre outil de recherche a été évalué et les résultats ont montré que le système de co-culture 3D soutient la viabilité cellulaire, l'activité métabolique cellulaire et la prolifération cellulaire. Ensuite, la modélisation des MICI a été la prochaine étape de notre étude. Nous avons utilisé le lipopolysaccharide (LPS) pour induire l'inflammation, puis nous avons ajouté de la dexaméthasone aux modèles traités au LPS pour supprimer l'inflammation. Nous avons évalué la réponse de notre modèle en mesurant les taux de cytokines TNFα et IL-1β dans le milieu de culture. Nos résultats ont montré que le modèle de co-culture 3D répondait au facteur inflammatoire en exprimant des niveaux plus élevés des cytokines ci-dessus par rapport au groupe témoin. De plus, après l'utilisation de la dexaméthasone dans les modèles traités au LPS, l'expression des cytokines a diminué. Nos résultats suggèrent que notre système de co-culture 3D est sensible à l'inflammation et aux thérapeutiques anti-inflammatoires. D'autres études pour la modélisation des MICI peuvent être réalisées en utilisant des cellules intestinales dérivées de patients atteints des MICI superposées sur la membrane basale des fibroblastes
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».