Understanding «Staphylococcus aureus» and associated inter-bacterial interactions to develop prophylactics and therapeutics for bovine clinical mastitis
Notice bibliographique
Résumé
La mammite bovine cause des dommages économiques considérables à l'industrie laitière canadienne, entraînant une perte annuelle de 600 millions de dollars. Parmi les agents pathogènes de la mammite, Staphylococcus aureus est l'agent étiologique le plus courant responsable de la mammite clinique et subclinique. Étant donné que la mammite clinique entraîne l'utilisation de quantités importantes d'antibiotiques en médecine vétérinaire, les souches de S. aureus résistants aux agents antimicrobiens (RAM) émergeant des fermes laitières constituent un important problème de santé publique. Plus récemment, l'utilisation d’importants antibiotiques médicaux a été progressivement abandonnée dans l'agriculture canadienne. Par conséquent, des tests diagnostiques précoces et de nouvelles stratégies prophylactiques/thérapeutiques pour le traitement et la prévention de la mammite bovine doivent être développés pour maintenir la durabilité de l'industrie laitière.Cette thèse caractérise le potentiel génétique de S. aureus associé aux bovins et étudie les interactions bactériennes entre S. aureus et les bactéries commensales bovines. Nous avons examiné la mammite clinique à S. aureus via trois approches différentes : la génomique comparative, les tests d'antagonisme interbactérien et le microbiome du lait.En résumé, les connaissances générées dans chacun des chapitres de recherche aident au développement de nouvelles stratégies de diagnostiques précoces et prophylactiques/thérapeutiques pour réduire la mammite clinique à S. aureus chez les bovins laitiers. Ultimement, ces connaissances contribueront à réduire à la fois l'utilisation d'antibiotiques en agriculture et le fardeau économique pour les fermes laitières canadiennes. De plus, la comprehension de la pathophysiologie de S. aureus sera extremement avantageux dans le contexte d'une One Health approche
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».