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Enregistrement W7162072031 · doi:10.82308/21216

The influence of genetics and psychosocial factors on cardiovascular diseases

2020· dissertation· en· W7162072031 sur OpenAlexaboutno aff
Gabriella Menniti

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPsychosocialDepression (economics)EpidemiologyGenetic epidemiologyDiseaseLogistic regressionGenome-wide association studyOdds ratioSocial isolationMarital status

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Cardiovascular disease (CVD) can be subcategorized into heart-related disorders(HRD) and peripheral/vascular-related disorders (PVRD). Genome-wide association studies (GWAS) have mainly identified genetic variants associated with HRD that can be used to develop a polygenic risk score (PRS) to quantify genetic risk. While GWAS have mainly been conducted in middle-aged adults, previous research suggests that genetics may have less of an influence on the risk of chronic diseases among the elderly and non-genetic factors may play a larger role. This includes psychosocial factors (PSFs) such as depression and social isolation that have been associated with CVD. Although gene-environment interactions studies have reported that a healthy lifestyle may mitigate polygenic risk of CVD, PSFs as moderators of polygenic risk of CVD have not been explored.Methods This cross-sectional study analyzed baseline data (n=9,892) from the Canadian Longitudinal Study on Aging. A PRS for CVD was constructed with 39 single nucleotide polymorphisms. Depressive symptoms assessed by the Center for Epidemiological Studies – Depression Scale were categorized into: “none” (Group 1, reference), “current” (Group 2), “clinical depression with no current symptoms” (Group 3) and “potential, recurrent depression” (Group 4). Social isolation index as a binary variable was comprised of marital status, living arrangements, retirement status, contacts, and social participation. The outcome measures were heart-related disorders (HRD: myocardial infarction, angina and heart disease) and peripheral/vascular-related disorders (PVRD: stroke, peripheral vascular disease and hypertension). Logistic regression was performed to generate adjusted odds ratios (ORs) for individual and interactive associations of PRS and PSFs on CVD, according to middle-aged (45- 69 years) and elderly (≥70 years) subgroups.vResults After adjusting for age, biological sex, total household income, education, smoking status, immigration status, province, urban/rural classification and the first five principal components of ancestry, PRS associated with HRD and PVRD among middle-aged participants (OR (95% confidence interval) (HRD: 1.06 (1.03-1.08) and PVRD: (1.02 (1.00-1.03)) but only with HRD among elderly (1.06 (1.03-1.08)). Among middle-aged participants, compared to the reference (group 1), the higher depressive symptoms groups associated with both HRD and PVRD, respectively (group 3: 1.21 (1.21-2.01), 1.49 (1.28-1.74); group 4: 1.75 (1.28-2.39), 1.73 (1.41-2.12)), while group 2 of depressive symptoms associated with only PVRD (1.28 (1.07- 1.53)). Among elderly participants, only group 4 compared to reference associated with PVRD (1.69 (1.08-2.64)). Social isolation associated with only PVRD among middle-aged participants (1.84 (1.04-3.26)). No significant PRS*PSFs interactions were observed.Conclusion: This study suggests that PSFs may not act as moderators for polygenic risk of CVD. However, genetics and PSFs are individually associated with CVD, which may vary according to the stage of the life course and anatomical location of CVD outcome

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,164

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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