Evaluation and differentiation of garlic cultivars growing in Québec using phenotypic and genotypic traits
Notice bibliographique
Résumé
Garlic (Allium sativum L.) production in Québec represents only 10% of the local market. Local production is restrained in part by a lack of knowledge on the phenotypic and genotypic stability of different cultivars grown locally. The goals of this project were to study the phenotypic variation in a set of garlic cultivars grown in different environments in Québec, differentiate them using DNA polymorphic patterns, and compare the morphological classification to the genetic one. A two-year field trial was conducted in Lac Saint-Jean and Montréal areas with 36 garlic cultivars of different types. In the first part of this study, cultivars were characterized morphologically by measuring the size, shape and arrangement of leaves, pseudostems, scapes, bulbils, bulbs and cloves. Although differences between cultivar types were identified, it was not possible to obtain a unique set of morphological characteristics specific to each cultivar. Also, yield and yield related characteristics varied widely between environments and within environments. In the second part of this study, 35 microsatellite regions were screened and 21 markers have finally been used to differentiate our cultivars. Overall, garlic types were different genetically, but the cultivars within a type were generally identical resulting in redundancy for 61% of our set of cultivars. Since garlic is propagated by clones, it is likely duplicates, but some cultivars like ‘Rose de Lautrec’ showed major morphological differences with other cultivars found to be genetically identical. We also found that the cultivars, previously reported to show more than one phenotype had also more than one genotype. A more thorough investigation using advanced genotyping technique is needed to get better insight in the genetic identity of cultivars studied herein
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».