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Enregistrement W7162082486 · doi:10.82308/27712

Evaluation and differentiation of garlic cultivars growing in Québec using phenotypic and genotypic traits

2021· dissertation· en· W7162082486 sur OpenAlexaboutno aff
Emily Savaria

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCultivarAllium sativumGenotypeMicrosatelliteYield (engineering)Phenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Garlic (Allium sativum L.) production in Québec represents only 10% of the local market. Local production is restrained in part by a lack of knowledge on the phenotypic and genotypic stability of different cultivars grown locally. The goals of this project were to study the phenotypic variation in a set of garlic cultivars grown in different environments in Québec, differentiate them using DNA polymorphic patterns, and compare the morphological classification to the genetic one. A two-year field trial was conducted in Lac Saint-Jean and Montréal areas with 36 garlic cultivars of different types. In the first part of this study, cultivars were characterized morphologically by measuring the size, shape and arrangement of leaves, pseudostems, scapes, bulbils, bulbs and cloves. Although differences between cultivar types were identified, it was not possible to obtain a unique set of morphological characteristics specific to each cultivar. Also, yield and yield related characteristics varied widely between environments and within environments. In the second part of this study, 35 microsatellite regions were screened and 21 markers have finally been used to differentiate our cultivars. Overall, garlic types were different genetically, but the cultivars within a type were generally identical resulting in redundancy for 61% of our set of cultivars. Since garlic is propagated by clones, it is likely duplicates, but some cultivars like ‘Rose de Lautrec’ showed major morphological differences with other cultivars found to be genetically identical. We also found that the cultivars, previously reported to show more than one phenotype had also more than one genotype. A more thorough investigation using advanced genotyping technique is needed to get better insight in the genetic identity of cultivars studied herein

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,957
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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