Isotopologue Ratios Identify 13C-Depleted, Methanotrophic Biomarkers in Complex Environmental Samples
Notice bibliographique
Résumé
Summary Our study introduces a novel isotopologue-based approach for compound-specific isotope analysis (CSIA) using ultra-high-performance liquid chromatography–high-resolution mass spectrometry (UHPLC/HRMS), which extends d¹³C analysis to non-volatile, intact lipids typically inaccessible to conventional gas chromatography–isotope ratio mass spectrometry (GC/irMS). By leveraging the distinct imprint of ¹³C-depletion in isotopologue distributions, particularly the M1/M0 ratio, our method enables the reliable identification of ¹³C-depleted methanotrophic lipids in complex environmental systems. Method development, based on archaeol, a lipid amenable to both GC/irMS and UHPLC/HRMS, demonstrated a strong correlation (R = 0.94) between d¹³C values derived from our isotopologue-based approach and conventional GC/irMS. Subsequent application to lipid extracts from the Guaymas Basin, characterized by the widespread occurrence of anaerobic methane oxidation (AOM), proved highly effective in differentiating biomarkers strongly associated with methane-oxidizing archaea, such as intact archaeol derivatives, from those derived from other non-methanotrophic sources. These findings underscore the potential of isotopologue-based CSIA using UHPLC/HRMS as a powerful new tool for tracing methanotrophic microbial communities and methane cycling in modern and paleo-environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».