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Enregistrement W7165936841 · doi:10.3724/cbb-t20-040

PCR Detection of Phytoplasma from Sweet Potato Witches' Broom Disease

2001· article· en· W7165936841 sur OpenAlexaboutno aff
Ping LAN, Wen-Feng LI, Shui-Fang ZHU, Zhen-Yi WANG

Notice bibliographique

Revue植物学通报 · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytoplasmaBroomAster yellowsPolymerase chain reaction16S ribosomal RNAReal-time polymerase chain reactionConvolvulaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using the software of PCRDESN, two pairs of primers, R<sub>16</sub>mF<sub>2</sub>/R<sub>16</sub>mR<sub>2</sub> and R<sub>16</sub>F<sub>2</sub>/R16R<sub>2</sub>, were designed based on the 16S rDNA sequence of Phytoplasma from Michigen Aster yellows (MIAY), Elm yellows (EY), Canadian peach X-disease (CX), Jujube witches' broom (JWB) and Cherry lethal yellow (CLY) published in references. DNAs as templates were extracted from sweet potato midrib infected with or without Phytoplasma. Phytoplasma in sweet potato witches' broom was detected using PCR and Nested-PCR. A Phytoplasma-specific 1.5 kb fragment and a 1.2 kb special fragment were amplified with PCR and Nested-PCR, respectively. The minimal amount of DNA extracted from the infected sweet potato for molecular detection using PCR and Nested-PCR were 107.3 pg/μl and 0.01073 pg/μl. It is showed that the methods of PCR and Nested-PCR were very sensitive, rapid and reliable in detecting sweet potato disease associated with Phytoplasma. Furthermore, Nested-PCR based on the PCR was more sensitive than PCR about 10000 times in detecting phytoplasma in sweet potato witches' broom. The conclusion is that the molecular detection of Phytoplasma in sweet potato witches' broom is a better method nowadays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,697
Score d'incertitude au seuil0,473

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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