PCR Detection of Phytoplasma from Sweet Potato Witches' Broom Disease
Notice bibliographique
Résumé
Using the software of PCRDESN, two pairs of primers, R16mF2/R16mR2 and R16F2/R16R2, were designed based on the 16S rDNA sequence of Phytoplasma from Michigen Aster yellows (MIAY), Elm yellows (EY), Canadian peach X-disease (CX), Jujube witches' broom (JWB) and Cherry lethal yellow (CLY) published in references. DNAs as templates were extracted from sweet potato midrib infected with or without Phytoplasma. Phytoplasma in sweet potato witches' broom was detected using PCR and Nested-PCR. A Phytoplasma-specific 1.5 kb fragment and a 1.2 kb special fragment were amplified with PCR and Nested-PCR, respectively. The minimal amount of DNA extracted from the infected sweet potato for molecular detection using PCR and Nested-PCR were 107.3 pg/μl and 0.01073 pg/μl. It is showed that the methods of PCR and Nested-PCR were very sensitive, rapid and reliable in detecting sweet potato disease associated with Phytoplasma. Furthermore, Nested-PCR based on the PCR was more sensitive than PCR about 10000 times in detecting phytoplasma in sweet potato witches' broom. The conclusion is that the molecular detection of Phytoplasma in sweet potato witches' broom is a better method nowadays.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».