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Human MRP2 polymorphisms and their impact on substrate transport

2008· article· en· W7707487 sur OpenAlexaff
Vandana Megaraj, Philip M. Gerk, Richard Kim, Mary Vore

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultidrug resistance-associated protein 2Single-nucleotide polymorphismOrganic anion-transporting polypeptideChemistryBiologySNPInternal medicineEndocrinologyTransporterATP-binding cassette transporterBiochemistryGeneGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug resistance protein 2 (MRP2/ABCC2) mediates the biliary excretion of endo‐ and xenobiotic organic anion conjugates. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the MRP2 gene contribute to variability in drug response and adverse effects between individuals and different ethnic populations. We characterized the transport of wild type MRP2 (WT) and two MRP2 SNP variants, M4 (A1450T) and M5 (V417I) for the substrates LTC 4 (leukotrieneC4), E 2 3G (estradiol‐3‐glucuronide), TUDC (tauroursodeoxycholic acid) and E 2 17G (estradiol‐17β‐lucuronide) Methods : WT, M4 and M5 were expressed in Sf9 insect cells and kinetic parameters (K m , μM; V max , pmol/mg −1 .min −1 ; Hill coefficient [HC]) of ATP dependant transport of 3 H‐LTC 4 , 3 H‐E 2 3G, 3 H‐TUDC and 3 H‐E 2 17G determined in Sf9 plasma membrane vesicles. Transport activity of M4 and M5 was normalized to WT protein expression. Results Conclusion The SNP in the nucleotide‐binding domain of M4 decreased the V max by 50% for LTC 4 , E 2 3G and TUDC and decreased the HC for TUDC and E 2 17G. The SNP in the transmembrane domain 2 of M5 minimally influenced the V max , but increased the K m 2–3 fold, increased the HC for TUDC and decreased the HC for E 2 17G. (HD 58299)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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