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Enregistrement W773593475 · doi:10.1128/9781555816858.ch23

The Emergence of <i>Cryptococcus gattii</i> Infections on Vancouver Island and Expansion in the Pacific Northwest

2014· book-chapter· en· W773593475 sur OpenAlexaffabout
Karen H. Bartlett, Edmond J. Byrnes, Colleen Duncan, Murray Fyfe, Eleni Galanis, Joseph Heitman, Linda Hoang, Sarah Kidd, Laura MacDougall, Sunny Mak, Kieren A. Marr, Muhammad Morshed, Sarah West, James W. Kronstad

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Centre for Disease ControlIsland HealthUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCryptococcus gattiiGeographyCryptococcusBiologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter outlines issues that were quickly explored, starting with the realization in 2001 that Vancouver Island was a hot spot for a pathogen not previously described as endemic and not restricted to tropical and subtropical climates. The picture of the outbreak that has developed has implications for global travel, climate change, land use patterns, and environmental colonization. Importantly, cryptococcosis caused by Cryptococcus gattii now serves as an excellent illustration of the impact of pathogen spread into a clement ecological niche, in this case, one that happened to be in a major population center of western Canada and the Pacific Northwest. Symptoms and clinicopathological changes in animals on Vancouver Island were consistent with disease reported elsewhere. The most common primary system involved was respiratory, followed by the central nervous system (CNS), in both cats and dogs. Animal cryptococcosis due to C. gattii is a nonregulated disease in Canada. Molecular typing of C. gattii environmental isolates from Vancouver Island using PCR fingerprinting and/or restriction fragment length polymorphism methodologies revealed that the majority of isolates belonged to the VGII molecular type and a small number belonged to the VGI molecular type. A number of solid culture media, biochemical tests, and stains can confirm the diagnosis of Cryptococcus to the genus level. Ecological niche modeling was employed to identify geographical areas in British Columbia with suitable environmental conditions to support the permanent colonization of C. gattii in the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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