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Enregistrement W82000409 · doi:10.1007/978-1-62703-056-4_3

Live-Cell Migration and Adhesion Turnover Assays

2012· article· en· W82000409 sur OpenAlexafffund
Judith Lacoste, Katherine A. Young, Claire M. Brown

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésAdhesionCell adhesionCell biologyBiologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescence microscopy has revolutionized the way live-cell imaging is achieved. At the same time, it is also potentially harmful to a living specimen. Therefore, the specimen must be monitored for viability and health before, during, and after imaging sessions. Methods for monitoring cell viability and health will be discussed in this chapter. Another key to successful live-cell imaging is to minimize light exposure as much as possible. A summary of strategies for minimizing light exposure including maximizing the light throughput of the microscope and the sensitivity of light detection is presented. Various fluorescence microscopy techniques are presented with a focus on how the light is delivered to the sample (i.e., light density) and pros and cons for use with living specimens. The reader is also directed to other publications that go into these topics in more detail. Methods are described on how to prepare samples for single cell migration assays, how to measure cell migration rates (e.g., bright-field, semi-automated, and automated), and how to measure focal adhesion turnover rates. Details of how to correct images for background intensity and field-illumination uniformity artifacts for quantitative imaging are also described. Overall, this chapter will be helpful to scientists who are interested in imaging live specimens using fluorescence microscopy techniques. It will be of particular interest to anyone wanting to perform quantitative fluorescence imaging, and wanting to measure cell migration rates, and focal adhesion dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,361 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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