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Enregistrement W825001808 · doi:10.1139/o09-045

Novel role for the <i>Saccharomyces cerevisiae</i> oligopeptide transporter Opt2 in drug detoxificationIn memory of Ghassan Belhadj.

2009· article· en· W825001808 sur OpenAlexaffvenue
Mustapha Aouida, Ali Khodami-Pour, Dindial Ramotar

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVacuoleMutantSaccharomyces cerevisiaeOligopeptideTransporterBiochemistryBiologyCell biologyPeptideChemistryGeneCytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Saccharomyces cerevisiae Opt2 is a member of the oligopeptide transporter family that was initially identified to transport tetra- and pentapeptides. Mutants deleted for the OPT2 gene exhibit no growth defects under normal culture conditions. We identified OPT2 from a high-throughput screen that when deleted results in mutants that displayed sensitivity to the anticancer agent bleomycin. The opt2Delta mutant was also reisolated in two additional genome-wide screens designed to identify mutants that are sensitive to the immunosuppressant rapamycin and the divalent metal ion zinc. However, the role of Opt2 in protecting cells against these agents was not investigated. Herein, we show that opt2Delta mutants are also sensitive to a wide variety of toxic agents that are typically detoxified by the vacuoles. Mutants lacking two other related oligopeptide transporters, Opt1 and Ygl114w, showed no significant sensitivities to these drugs, indicating a specific role for Opt2 in drug detoxification. The sensitivities of the opt2Delta mutants were not related to an increased drug uptake but rather to the presence of several small vesicles instead of a functional large vacuole. We propose that Opt2 has a novel function involving the fusion of vesicles to form a mature vacuole.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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