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Enregistrement W846164694

Eukaryotic and Prokaryotic Sources of Colonic Hydrogen Sulfide Synthesis

2012· dissertation· en· W846164694 sur OpenAlexfundno aff
Kyle L. Flannigan

Notice bibliographique

RevueMacSphere (McMaster University) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSulfur Compounds in Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCrohn's and Colitis Foundation of CanadaCrohn's and Colitis Foundation
Mots-clésHydrogen sulfideComputational biologyChemistryBiologySulfurOrganic chemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hydrogen sulfide (H2S) is an important modulator of many aspects of digestive function, both in health and disease. Colonic tissue H2S synthesis increases markedly during injury and inflammation and contributes to resolution. Some of the bacteria residing in the colon also produce H2S. The extent to which bacterial H2S synthesis contributes to what is measured as colonic H2S synthesis is not clear. When comparing conventional and germ-free mice we found no differences in colonic H2S synthesis. Furthermore, we found that colonic H2S synthesis is markedly increased when colonic tissue is inflamed, and, in proportion to the extent of inflammation, however fecal H2S synthesis does not change. Finally, rats fed a B vitamin-deficient diet for 6 weeks exhibited significantly diminished colonic H2S synthesis, but fecal H2S synthesis was not different from that of rats on the control diet. Our results demonstrate that H2S production by colonic bacteria does not contribute significantly to what we measure as colonic tissue H2S production. In another study, the contributions of three enzymatic pathways to colonic H2S synthesis were determined in tissues taken from healthy rats and rats with colitis. The ability of colonic tissue to inactivate H2S was also determined. The majority of increased H2S synthesis, in both healthy and inflamed tissue, was derived via a pyroxidal-5’-phosphate-independent pathway. Ulcerated mucosal tissue accounted for the greatest levels of H2S synthesis, and the extent of granulocyte infiltration into the tissue did not appear to be a significant determinant of the levels of H2S production. Inactivation of H2S by colonic tissue occurred rapidly, but was significantly reduced in ulcerated colonic tissue from rats with colitis. Damage to colonic tissue appears to be the major stimulus for enhanced H2S synthesis. Together, the increased production and decreased inactivation of H2S may contribute to promoting resolution of inflammation and repair of damaged colonic tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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