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Enregistrement W869891235 · doi:10.1186/2046-2530-4-s1-p6

Abnormalities in primary cilium of osteoblasts of adolescent idiopathic scoliosis patients

2015· article· en· W869891235 sur OpenAlexaffabout
Niaz Oliazadeh, Anne Marie Franco, D Wang, A. Moreau

Notice bibliographique

RevueCilia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du QuébecCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiliumScoliosisIdiopathic scoliosisBiologyExome sequencingMedicineDiseaseBioconductorBioinformaticsPathologyCell biologyGeneGeneticsMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adolescent Idiopathic Scoliosis (AIS) is a common complex genetic disease and one of the most prevalent childhood deformities. AIS is clinically characterized by a 3D spinal deformity with unknown cause. The aim of this study is to identify rare genetic variants and associated biological pathways involved in AIS onset and its progression. We recently completed exome sequencing of 69 AIS cases vs. 70 matched controls in a French-Canadian AIS cohort using SOLiD 5 technology. Results showed two gene families with significant enrichment for single nucleotide variants (SNVs) involved in cilia signalling pathways. To investigate the functional effect of these SNVs, we explored biomechanical responses on osteoblasts from AIS patients carrying these SNVs. More specifically, we applied a sinusoidal/oscillatory fluid flow at 2Pa, 0.5Hz for 90min using parallel plate flow chamber. Preliminary qPCR results of the cells post flow showed a significant increase (+10-folds) in the expression of cyclooxygenase-2 (COX2) in AIS cells versus control ones. Interestingly, microscopy imaging of the same cells revealed a 30% increase in the length of cilia (p<0.01) of AIS cells when compared to control ones. Of note, increased COX2 expression has been reported as a flow mediated response for bone cells. Our results suggest an increased sensitivity of AIS bone cells to fluid flow due to the elongation of cilia. Although cilia abnormalities have never been investigated in idiopathic scoliosis, ciliary structural and functional abnormalities in AIS osteoblasts might be involved in the onset and progression of the disease. More extensive experiments are currently underway to confirm the role of cilia in AIS pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,165
Score d'incertitude au seuil0,365

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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