MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W870259885 · doi:10.1128/9781555817732.ch5

Partition Systems of Bacterial Plasmids

2014· book-chapter· en· W870259885 sur OpenAlexaff
Barbara E. Funnell, Roderick Slavcev

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmidExtrachromosomal DNABiologyOrigin of replicationCell biologyCell divisionBacillus subtilisEscherichia coliBacterial cell structureGeneticsDNA replicationCellGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasmids, as extrachromosomal elements, bear the burden of ensuring their own faithful segregation at cell division. This chapter reviews partition systems, which are, in general, systems that actively dictate the specific localization of plasmids inside the bacterial cell and coordinate this localization with the bacterial cell cycle. Partition systems also exert incompatibility, which is distinct from the replication-mediated incompatibility that has been used to classify plasmids. Growth of the membrane between attachment sites was proposed to push plasmids apart. It was subsequently shown that membrane growth is dispersive and thus cannot solely account for plasmid movement. An appealing candidate for the plasmid road sign is the bacterial replication apparatus. Experiments in Escherichia coli and Bacillus subtilis indicate that the replication machinery exists as localized factories in the cell. The intracellular localization patterns of the ParA from the E. coli virulence plasmid pB171 provide an intriguing clue as to the mechanism of ParA function. RepA and RepB are not essential for replication but are essential for plasmid stability. They have been shown to influence copy number, but this may be due to effects on the expression of repC. Recent cell biology, biochemical, and structural data show that R1 ParM looks and behaves like actin and suggest a partition model in which ParM acts as a cytoskeletal element to drive the movement of plasmids during the cell cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueASM Press eBooksMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207