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Enregistrement W90965184 · doi:10.1002/humu.22924

Mandibulofacial Dysostosis with Microcephaly: Mutation and Database Update

2015· review· en· W90965184 sur OpenAlexafffund
Lijia Huang, Megan R. Vanstone, Taila Hartley, Matthew Osmond, Nick Barrowman, Judith Allanson, Laura Baker, Tabib A. Dabir, Katrina M. Dipple, William B. Dobyns, Jane Estrella, Hanna Faghfoury, Francine Pinheiro Favaro, Himanshu Goel, Pernille Axél Gregersen, Karen W. Gripp, Art Grix, M. L. Guion‐Almeida, Margaret Harr, Cindy Hudson, Alasdair G. W. Hunter, John P. Johnson, Shelagh Joss, Amy Kimball, Usha Kini, Antonie D. Kline, Julie Lauzon, Dorte L. Lildballe, Vanesa López‐González, Johanna Martinezmoles, Cliff Meldrum, Ghayda Mirzaa, Chantal F. Morel, Jenny E.V. Morton, Louise C. Pyle, Fabiola Quintero‐Rivera, Julie Richer, Angela E. Scheuerle, Bitten Schönewolf‐Greulich, Deborah Shears, Josh Silver, Amanda Smith, I. Karen Temple, Jiddeke M. van de Kamp, Fleur S van Dijk, Anthony M. Vandersteen, Sue M. White, Elaine H. Zackai, Ruobing Zou, Dennis E. Bulman, Kym M. Boycott, Matthew A. Lines

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCraniofacial Disorders and Treatments
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreAlberta Children's HospitalNewborn Screening OntarioUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMount Sinai HospitalUniversity of CalgaryChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchOntario GenomicsNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics InstituteWorld Health Organization
Mots-clésMicrocephalyBiologyMissense mutationTreacher Collins syndromeHaploinsufficiencyGeneticsCraniofacialHearing lossMutationGeneMedicineAudiologyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mandibulofacial dysostosis with microcephaly (MFDM) is a multiple malformation syndrome comprising microcephaly, craniofacial anomalies, hearing loss, dysmorphic features, and, in some cases, esophageal atresia. Haploinsufficiency of a spliceosomal GTPase, U5-116 kDa/EFTUD2, is responsible. Here, we review the molecular basis of MFDM in the 69 individuals described to date, and report mutations in 38 new individuals, bringing the total number of reported individuals to 107 individuals from 94 kindreds. Pathogenic EFTUD2 variants comprise 76 distinct mutations and seven microdeletions. Among point mutations, missense substitutions are infrequent (14 out of 76; 18%) relative to stop-gain (29 out of 76; 38%), and splicing (33 out of 76; 43%) mutations. Where known, mutation origin was de novo in 48 out of 64 individuals (75%), dominantly inherited in 12 out of 64 (19%), and due to proven germline mosaicism in four out of 64 (6%). Highly penetrant clinical features include, microcephaly, first and second arch craniofacial malformations, and hearing loss; esophageal atresia is present in an estimated ∼27%. Microcephaly is virtually universal in childhood, with some adults exhibiting late "catch-up" growth and normocephaly at maturity. Occasionally reported anomalies, include vestibular and ossicular malformations, reduced mouth opening, atrophy of cerebral white matter, structural brain malformations, and epibulbar dermoid. All reported EFTUD2 mutations can be found in the EFTUD2 mutation database (http://databases.lovd.nl/shared/genes/EFTUD2).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0120,015
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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