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Enregistrement W918445402 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.888.12

Recognition Specificity of Leukocyte Integrin α <b> <sub>M</sub> β </b> <b> <sub>2</sub> (Mac‐1, CD11b/CD18) and its Functional Consequences </b>

2015· article· en· W918445402 sur OpenAlexaff
Nataly P. Podolnikova, Valeryi K. Lishko, Thomas A. Haas, Tatiana P. Ugarova

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésIntegrin alpha MIntegrinPeptidePattern recognition receptorPhage displayReceptorBiologyCathelicidinSequence motifInnate immune systemChemistryCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The broad recognition specificity exhibited by integrin αMβ2 has allowed this adhesion receptor to play innumerable roles in leukocyte biology, yet we know little how and why αMβ2 binds its ligands. Within αMβ2, the αMI-domain is responsible for integrin's multiligand binding properties. To determine its recognition motif, we screened peptide libraries spanning sequences of many known protein ligands for the αMI-domain binding and also selected the αMI-domain recognition sequences by phage display. A key feature of the αMI-domain recognition motif is a small core consisting of basic amino acids flanked by hydrophobic residues. Identification of the motif allowed the construction of an algorithm which reliably predicts the αMI-domain binding sites in the αMβ2 ligands. The recognition specificity of the αMI-domain resembles that of some chaperones which enables it to bind segments exposed by protein denaturation. The disclosure of the αMβ2 binding preferences allowed the prediction that cationic host defense peptides, which are strikingly enriched in the aMI-domain recognition motifs, represent a new class of αMβ2ligands. This prediction has been tested by examining the interaction of αMβ2 with the human cathelicidin peptide LL-37. LL-37 induced a potent αMβ2-dependent cell migratory response, caused activation of αMβ2 on neutrophils and αMβ2-mediated signaling in monocytes. The newly revealed recognition specificity of αMβ2 towards unfolded protein segments and cationic proteins/peptides suggests that αMβ2 may serve as a previously proposed “alarmin” receptor with important roles in innate host defense. NIH HL 63199

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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