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Enregistrement W929564192 · doi:10.1371/journal.pone.0132607

The Intracellular Localisation and Phosphorylation Profile of the Human 5-Lipoxygenase Δ13 Isoform Differs from That of Its Full Length Counterpart

2015· article· en· W929564192 sur OpenAlexafffund
Éric P. Allain, Luc H. Boudreau, Nicolas Flamand, Marc E. Surette

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire de Cardiologie et de Pneumologie de QuébecUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesFondation de la recherche en santé du Nouveau-BrunswickNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBiosynthesisArachidonate 5-lipoxygenaseMutantGene isoformHEK 293 cellsBiologyTransfectionCell biologyMolecular biologyBiochemistryEnzymeArachidonic acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5-Lipoxygenase (5-LO) catalyzes leukotriene (LT) biosynthesis by a mechanism that involves interactions with 5-lipoxygenase activating protein (FLAP) and coactosin-like protein (CLP). 5-LO splice variants were recently identified in human myeloid and lymphoid cells, including the catalytically inactive ∆13 isoform (5-LO∆13) whose transcript lacks exon 13. 5-LO∆13 inhibits 5-LO product biosynthesis when co-expressed with active full length 5-LO (5-LO1). The objective of this study was to investigate potential mechanisms by which 5-LO∆13 interferes with 5-LO product biosynthesis in transfected HEK293 cells. When co-expressed with 5-LO1, 5-LO∆13 inhibited LT but not 5-hydroxyeicosatetraenoic acid (5-HETE) biosynthesis. This inhibition was independent of 5-LO∆13-FLAP interactions since it occurred in cells expressing FLAP or not. In cell-free assays CLP enhances 5-LO activity through interactions with tryptophan-102 of 5-LO. In the current study, the requirement for W102 was extended to whole cells, as cells expressing the 5-LO1-W102A mutant produced little 5-LO products. W102A mutants of 5-LO∆13 inhibited 5-LO product biosynthesis as effectively as 5-LO∆13 suggesting that inhibition is independent of interactions with CLP. Confocal microscopy showed that 5-LO1 was primarily in the nucleoplasm whereas W102A mutants showed a diffuse cellular expression. Despite the retention of known nuclear localisation sequences, 5-LO∆13 was cytosolic and concentrated in ER-rich perinuclear regions where its effect on LT biosynthesis may occur. W102A mutants of 5-LO∆13 showed the same pattern. Consistent with subcellular distribution patterns, 5-LO∆13 was hyper-phosphorylated on S523 and S273 compared to 5-LO1. Together, these results reveal a role for W102 in nuclear targeting of 5-LO1 suggesting that interactions with CLP are required for nuclear localization of 5-LO1, and are an initial characterisation of the 5-LO∆13 isoform whose inhibition of LT biosynthesis appears independent of interactions with CLP and FLAP. Better knowledge of the regulation and properties of alternative 5-LO isoforms will contribute to understanding the complex regulation of LT biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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