The use of 5-tert-butylproline to study nucleation of polyproline type I conformation
Notice bibliographique
Résumé
Prolyl amide geometry dictates two kinds of helical conformations in polyproline [1]. Nterminal amides to proline are all cis-isomers in type I polyproline (PPI), which is a right handed helix with an axial translation of 190 pm. Type II polyproline (PPII) is a left handed helix with an axial translation of 320 pm due to the prolyl amides existing as trans-isomers. Peptides adopting PPII conformations have been observed to bind to kinases, SH2 and SH3 domains, and MHC class II proteins by NMR spectroscopy and X-ray crystallography [2]. Because of conformational lability, PPI has been studied mostly in the solid state by X-ray diffraction and little is known about this peptide structure and its relevance in protein biology [1-3]. In order to better characterize the physical and biological properties of PPI, we are using the steric interactions of 5-alkylprolines to augment cis-isomer populations in polyproline helices. We report attempts to induce PPI geometry in water by incorporating 5tert-butylproline (tBuPro) into polyproline hexamers as studied by NMR and CD spectroscopy.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».