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Enregistrement W959364689 · doi:10.1021/acsmacrolett.5b00340

Experimental Evidence of Weak Excluded Volume Effects for Nanochannel Confined DNA

2015· article· en· W959364689 sur OpenAlexafffund
Damini Gupta, Jeremy J. Miller, Abhiram Muralidhar, Sara Mahshid, Walter Reisner, Kevin D. Dorfman

Notice bibliographique

RevueACS Macro Letters · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNanopore and Nanochannel Transport Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesDivision of Materials ResearchNational Human Genome Research InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Science FoundationMinnesota Supercomputing Institute, University of MinnesotaNational Institutes of HealthFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésScalingShearing (physics)DispersityExcluded volumeVolume (thermodynamics)Materials scienceNanotechnologySpectroscopyStatistical physicsChemical physicsPhysicsThermodynamicsMathematicsQuantum mechanicsPolymer chemistryGeometryPolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present experimental demonstration that weak excluded volume effects arise in DNA nanochannel confinement. In particular, by performing measurements of the variance in chain extension as a function of nanochannel dimension for effective channel sizes ranging from 305 to 453 nm, we show that the scaling of the variance in extension with channel size rejects the de Gennes scaling δ 2 X ∼ D 1/3 in favor of δ 2 X ∼ D 0 using uncertainty at the 95% confidence level. We also show how simulations and confinement spectroscopy can be combined to reduce molecular weight dispersity effects arising from shearing, photocleavage, and nonuniform staining of DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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