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Enregistrement W96714039 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.829.3

Co‐localization of nodal in hypoxic regions of tumours as seen using confocal microscopy and stereoscopic 3D reconstruction methods

2009· article· en· W96714039 sur OpenAlexaffabout
Tamara Stock, Timothy D. Wilson, Lynne‐Marie Postovit

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNODALHypoxia (environmental)Confocal microscopyConfocalBreast cancerPathologyBiologyMetastasisCancer researchMedicineCancerChemistryInternal medicineAnatomyCell biologyOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metastatic breast cancer is associated with a poor clinical prognosis. Understanding the factors that promote metastasis is required so that new treatments can be derived. Studies have shown that low oxygen levels (hypoxia) characterize the microenvironment of many tumours and that tumour hypoxia is correlated with increased metastatic potential. Nodal, an embryonic growth factor, is associated with tumour progression in breast cancer. Previous work indicates that Nodal is up‐regulated in response to hypoxia. The aim of this study was to investigate the co‐localization of Nodal with areas of hypoxia within three‐dimensional (3D) tumour spheroids. A poorly metastatic, well differentiated, human breast cancer cell line (MCF‐7) was grown as mammospheres and fixed using paraformaldahyde. Nuclei, hypoxia, and Nodal were simultaneously detected using immunofluorescence. Stained mammospheres were whole mounted for optical sectioning using a confocal microscope. Images were obtained at a slice thickness of 1‐2µm. Images were compiled and rendered into a 3D image using digital segmentation software. The co‐localization of Nodal and areas of hypoxia within the mammospheres were observed. Early results indicate that there may be pockets of hypoxic regions within the mammospheres and it is anticipated that Nodal will be up‐regulated in these areas. Research support: Canadian Institute of Health Research. Grant Funding Source Internal

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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