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Enregistrement W96929193 · doi:10.2310/6620.2009.09038

Local Lymph Node Data for the Evaluation of Skin Sensitization Alternatives: A Second Compilation

2010· article· en· W96929193 sur OpenAlexvenueno aff
Petra Kern, Frank G. Gerberick, Cindy A. Ryan, Ian Kimber, Aynur O. Aptula, David A. Basketter

Notice bibliographique

RevueDermatitis · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueContact Dermatitis and Allergies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocal lymph node assaySkin sensitizationDatabaseMedicineComputer scienceIdentification (biology)ToxicologySensitizationImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Development, evaluation and validation of alternatives to skin sensitisation testing require the availability of reliable databases with which comparative analyses can be conducted to establish performance characteristics. To facilitate this we have published previously a database comprising results from local lymph node assays (LLNAs) conducted with 211 chemicals. That database embraced a substantial range of chemistry, and of relative skin sensitising potency, and has found application in the assessment of new or refined methods. OBJECTIVE: In this paper we describe a second compilation to extend the LLNA database. METHODS: This second data compilation was derived from previously conducted LLNA studies involving an additional 108 chemicals. In addition, the first database contained a small number of inaccuracies, affecting results recorded with a few chemicals. In this paper these have been corrected. RESULTS: The inclusion of 108 new substances has served to extend and consolidate the areas of chemistry covered by the database. In addition, the entire dataset was evaluated for pre and prohaptens which will facilitate the choice of chemicals for alternative assay developments. CONCLUSIONS: It is anticipated that the new revised and extended database totalling over 300 chemicals will now serve as the primary resource to support the development and evaluation of new approaches to hazard identification and potency assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0160,010
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations193
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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