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Enregistrement W977502173 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.714.8

Hypoxia Reduces Mature HERG Channels through Calpain Up‐regulation and Activation

2015· article· en· W977502173 sur OpenAlexafffundabout
Shawn M. Lamothe, Shetuan Zhang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-cléshERGCalpainChemistryCell biologyTransfectionHypoxia (environmental)HEK 293 cellsPharmacologyPotassium channelBiologyBiochemistryBiophysicsEnzymeReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human ether‐à‐go‐go related gene (hERG) encodes the pore‐forming subunit of the I Kr channel, which is important for cardiac repolarization. Loss of function of the hERG channel causes long QT syndrome, a cardiac disorder with high risk of cardiac arrhythmias and sudden death. Patients with medical conditions, such as cardiac ischemia, are associated with prolonged QT intervals and arrhythmias. Since proteases, such as calpain, are upregulated and activated during cardiac ischemia and hypoxia, we investigated the role of calpain in hypoxia‐mediated hERG reduction. We demonstrate that hypoxic (0.5% O 2 ) culture of hERG‐expressing HEK cells and neonatal rat cardiomyocytes led to a significant reduction of mature hERG expression and a concomitant increase in calpain expression. Transfection of hERG‐HEK cells with calpain‐1 reduced mature hERG expression and was accompanied by a significant calpain expression in the cell culture media. Treatment of cells with media from calpain‐1 transfected cells reduced mature hERG channel expression and function. The calpain‐1‐mediated hERG reduction was completely prevented by the membrane‐impermeable calpain inhibitor peptide B27. Replacing the S5‐S6 pore linker of hERG with that of EAG completely eliminated the calpain‐1 and hypoxic culture‐induced hERG reduction. Application of a peptide (BeKm‐1), which binds specifically to hERG's extracellular S5‐pore linker, prevented calpain‐1 and hypoxic culture‐induced hERG reduction. We conclude that hypoxia decreases mature hERG expression by activating calpain, which cleaves the channel protein at the extracellular S5‐S6 pore linker leading to subsequent channel degradation. Supported by the Canadian Institutes of Health Research & the Heart and Stroke Foundation of Ontario

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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