Phenotypic characterization of mice carrying a <i>PTPN22</i> single nucleotide polymorphism associated with autoimmunity in humans (47.13)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Type 1 diabetes (T1D) is a strongly heritable autoimmune disease due to the destruction of pancreatic β-cells by self-reactive T-cells. The third strongest genetic locus for T1D involves a single-nucleotide polymorphism (SNP) causing an arginine(R) to triptophan(W) substitution at codon 620 (620R>W) in PTPN22, the gene encoding the tyrosine phosphatase LYP, an important negative regulator of T-cell receptor (TCR) activation. However, the cellular effects of the 620R>W risk allele remain controversial, as different studies report either a gain or a loss of function in its ability to inhibit TCR signaling. To study this variant in an animal model, we created a knock-in mouse by introducing the 620R>W substitution in, the murine LYP orthologue, PEP encoded by Ptpn22. The knock-in analyzed on the autoimmune-resistant C57Bl/6 background showed a mild but significant increase in CD4+ helper T-cell activation and proliferation upon weak TCR activation. Conversely, upon strong TCR stimulation, the tendency seemed to be reversed as the 620W allele showed a slightly decreased responsiveness compared to the 620R allele. Phenotypic analysis of other immune cellular compartments, including memory T cells, showed no significant difference between genotypes. There was no evidence of autoimmunity in this genetic background. This dependence of allelic effect on the strength of the TCR signal may reconcile previous observations and indicate a complex role of R620>W in autoimmunity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».