MétaCan
Menu
Back to cohort
Record W1576399336

Génétique des population de cèdre blanc de l’est (thuja occidentalis) dans la forêt boréale du nord-ouest québécois

2013· dissertation· fr· W1576399336 on OpenAlexfundaboutno aff
Huaitong Xu

Bibliographic record

VenueDepositum (Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue) · 2013
Typedissertation
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicGenetic diversity and population structure
Canadian institutionsnot available
FundersFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
KeywordsForestryGeographyBiology
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Le cèdre blanc de l’Est (CBE, Thuja occidentalis L.) est une espèce de fin de succession de la forêt boréale du Canada. L’objectif à long terme de cette étude était de mieux comprendre l’influence du climat et des feux sur la dynamique et la structure génétique des populations de CBE. Nous avons utilisé des marqueurs moléculaires pour: 1) étudier la diversité génétique des populations de CBE suivant un gradient latitudinal, 2) mettre en évidence l’importance du mode de régénération le long d’une succession après feu et évaluer l’effet de l’historique des perturbations sur la structure génétique du CBE, 3) estimer les effets des caractéristiques du paysage sur sa diversité génétique et la valeur des peuplements résiduels non brûlés pour la conservation de la diversité. Nous avons observé une augmentation du taux de consanguinité dans les populations marginales et discontinues. Toutefois, nous n’avons noté aucun effet latitudinal sur la diversité génétique (Hs), la richesse allélique (RA), ou la différentiation des populations (Fst) le long d’un gradient allant de la forêt boréale mixte à la forêt coniférienne du Nord du Québec. L’isolement plus enlevé des populations au nord de l’aire de répartition continue de l’espèce n’est apparemment pas lié à un effet décelable sur la diversité génétique. De façon générale, les populations marginales fragmentées de CBE semblent être protégées de l’érosion génétique. Notre étude a mis en évidence un patron de régénération dynamique le long d’un gradient de succession de 250 ans après feu. Le taux de régénération asexuée augmente légèrement avec l’accroissement du temps écoulé depuis le dernier feu (1916, 21.8%; 1823, 27.0%; 1760, 30.9%). Le site le plus jeune (1916) reçoit une proportion plus importante de flux de gènes (82.4%) en provenance des deux autres sites. La structure génétique spatiale à l’échelle du peuplement (SGS) est significative chez les gaules (hauteur moyenne: 60± cm) et plus faible chez les arbres adultes. La régénération végétative chez les gaules augmente la SGS sur de courtes distances. La distance des sources de graines, le temps requis pour que l’arbre arrive à maturité et produise des graines ainsi que la présence de microsites favorables sont parmi les facteurs contrôlant l’abondance du CBE le long de la succession après feu. La comparaison de paysage plus ou moins fragmentés incluant des petits îlots préservés, des vielles forêts et des peuplements situés sur les îles du lac Duparquet a mis en évidence une dynamique source-réservoir associée à la présence d’un taux élevé de flux de gènes entre les peuplements de CBE. Des différences significatives ont été notées entre les trois types de paysage pour la richesse allélique (RA) et la différentiation entre les populations (Fst). Comparativement aux autres sites, les peuplements résiduels non brûlés ont une RA (5.06) et un nombre d’allèles privés (AP = 5) plus faibles et le niveau de différenciation (Fst = 0.052) le plus élevé. Aussi bien le vent que les caractéristiques du paysage façonnent la structure génétique du CBE à travers les différents paysages. Des mesures appropriées devraient être prises pour protéger les vieux massifs continus de CBE avant qu’ils ne forment des îlots résiduels de petites dimensions caractérisés par une variation génétique plus faible.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.164
Threshold uncertainty score0.331

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0010.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.003
GPT teacher head0.187
Teacher spread0.184 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2013
Admission routes2
Has abstractyes

Explore more

Same venueDepositum (Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue)Same topicGenetic diversity and population structureFrench-language works237,207