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Record W1905882978

IDENTIFICAN NUEVAS FUNCIONES EN GENES DE ESCHERICHIA COLI

2007· article· es· W1905882978 on OpenAlexaboutno aff
José Luis Puente García, Laura Romero

Bibliographic record

VenueGaceta UNAM (2000-2009) · 2007
Typearticle
Languagees
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicMicrobial Metabolism and Applications
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsHumanitiesBiologyMolecular biologyPhilosophy
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

INVESTIGADORES DEL INSTITUTO DE BIOTECNOLOGIA (IIBT) IDENTIFICARON NUEVAS FUNCIONES EN LOS GENES DE LA BACTERIA ESCHERICHIA COLI ENTEROHEMORR GICA O157:H7, RELACIONADAS CON LA REGULACION DE LA EXPRESION Y SECRECION DE PROTEINAS. CON ELLO, DESCUBRIERON QUE EL REPERTORIO DE MOLECULAS, DENOMINADAS FACTORES DE VIRULENCIA -CON EL CUAL PUEDE CAUSAR PADECIMIENTOS COMO DIARREA, COLITIS HEMORR GICA Y SINDROME UREMICO HEMOLITICO- ES MUCHO M S AMPLIO DE LO CONSIDERADO HASTA AHORA. ASIMISMO, EL GRUPO UNIVERSITARIO QUE ENCABEZA JOSE LUIS PUENTE GARCIA -EN COLABORACION CON INTEGRANTES DE LA UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA, EN VANCOUVER, CANAD - PATENTA YA EN CERCA DE 20 NACIONES, ENTRE ELLAS ARGENTINA, CANAD , JAPON, MEXICO Y ESTADOS UNIDOS, LA APLICACION DE EXTRACTOS PROTEINICOS EN GANADO VACUNO PARA REDUCIR LA COLONIZACION DE E. COLI PATOGENA EN ESOS ANIMALES, LO QUE EVITARIA PERDIDAS MILLONARIAS EN ESA INDUSTRIA. EL INVESTIGADOR RECORDO QUE ESE MICROORGANISMO, CONOCIDO DESDE FINALES DEL SIGLO XIX, ES PARTE DE LA FLORA NORMAL O MICROBIANA QUE HABITA EN EL INTESTINO DE UN INDIVIDUO. CUANDO SE LE NOMBRA SE ASOCIA CON ENFERMEDAD, PERO POCOS SABEN QUE ES PARTE DEL SER HUMANO Y QUE AYUDA, POR EJEMPLO, A DIGERIR LOS ALIMENTOS Y A PRODUCIR VITAMINA K O COMPLEJO B, ESENCIALMENTE EN MUCHAS FUNCIONES CELULARES. NO OBSTANTE, ANADIO, COMO PARTE DE LA EVOLUCION, E. COLI HA ADQUIRIDO Y ASIMILADO DE OTROS MICROORGANISMOS INFORMACION GENETICA DE MANERA HORIZONTAL. ESO LE HA PERMITIDO DESARROLLAR NUEVAS ACTIVIDADES, MUCHAS DE LAS CUALES LE OTORGAN AHORA UN CAR CTER PATOGENO, Y SE HAN CLASIFICADO EN DIFERENTES GRUPOS. EN EL LABORATORIO DE PUENTE GARCIA SE ESTUDIAN DOS CLASES: LA E. COLI ENTEROPATOGENA (EPEC) QUE CAUSA DIARREA EN NINOS MENORES DE SEIS MESES DE EDAD EN PAISES EN DESARROLLO, Y LA E. COLI ENTEROHEMORR GICA (EHEC), AGENTE CAUSAL DE LO QUE SE CONOCE COMO LA ENFERMEDAD DE LAS HAMBURGUESAS, PORQUE SUS BROTES SE ASOCIAN, AUNQUE NO EN FORMA EXCLUSIVA, CON CARNE MOLIDA MAL COCIDA Y CON IMPACTO EN NACIONES INDUSTRIALIZADAS. EXPLICO QUE UNO DE LOS PORTADORES SANOS DE ESTA BACTERIA ES EL GANADO BOVINO. UNA DE LAS LINEAS DE INVESTIGACION DEL LABORATORIO DE JOSE LUIS PUENTE BUSCA ENTENDER COMO SE PROGRAMA LA EXPRESION DE FACTORES DE VIRULENCIA O HERRAMIENTAS BACTERIANAS SEMEJANTES, Y QUE EL CONOCIMIENTO B SICO GENERADO PUEDE SER UTILIZADO PARA CREAR MEDIDAS DE CONTROL, PREVENCION E, INCLUSO, CURA. TAMBIEN INTERESA IDENTIFICAR Y ENTENDER NUEVOS ELEMENTOS QUE LE PERMITEN A LA BACTERIA ALTERAR MECANISMOS O FUNCIONES DE LAS CELULAS INTESTINALES O ENTEROCITOS. POR SU IMPORTANCIA, SUS RESULTADOS SE HAN DIVULGADO EN PRESTIGIADAS PUBLICACIONES, COMO PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, DE EU, MOLECULAR MICROBIOLOGY Y EL JOURNAL OF BACTERIOLOGY. LUEGO DE DESCRIBIR LA INVESTIGACION, EL ESPECIALISTA EXPRESO QUE EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVAS FUNCIONES AYUDA A ENTENDER MEJOR LOS MECANISMOS QUE LE PERMITEN A ESTA BACTERIA CAUSAR ENFERMEDAD Y, A SU VEZ, DA LA OPORTUNIDAD DE CONTRIBUIR CON ESTRATEGIAS POTENCIALES PARA SU PREVENCION, FINALIZO.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.007

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.001
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0010.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.008
GPT teacher head0.255
Teacher spread0.247 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2007
Admission routes1
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