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Record W2189807600 · doi:10.1080/03632415.2015.1106944

A Simple Web-Based Tool to Compare Freshwater Fish Data Collected Using AFS Standard Methods

2015· article· en· W2189807600 on OpenAlexfundaboutno aff
Scott A. Bonar, Norman Mercado‐Silva, Matt Rahr, Yuta T. Torrey, Averill Cate

Bibliographic record

VenueFisheries · 2015
Typearticle
Languageen
FieldEnvironmental Science
TopicFish Ecology and Management Studies
Canadian institutionsnot available
FundersMinistry of Natural Resources
KeywordsFish <Actinopterygii>Simple (philosophy)FisheryComputer scienceBiologyPhilosophy

Abstract

fetched live from OpenAlex

Abstract The American Fisheries Society (AFS) recently published Standard Methods for Sampling North American Freshwater Fishes. Enlisting the expertise of 284 scientists from 107 organizations throughout Canada, Mexico, and the United States, this text was developed to facilitate comparisons of fish data across regions or time. Here we describe a user-friendly web tool that automates among-sample comparisons in individual fish condition, population length-frequency distributions, and catch per unit effort (CPUE) data collected using AFS standard methods. Currently, the web tool (1) provides instantaneous summaries of almost 4,000 data sets of condition, length frequency, and CPUE of common freshwater fishes collected using standard gears in 43 states and provinces; (2) is easily appended with new standardized field data to update subsequent queries and summaries; (3) compares fish data from a particular water body with continent, ecoregion, and state data summaries; and (4) provides additional information about AFS standard fish sampling including benefits, ongoing validation studies, and opportunities to comment on specific methods. The web tool—programmed in a PHP-based Drupal framework—was supported by several AFS Sections, agencies, and universities and is freely available from the AFS website and fisheriesstandardsampling.org. With widespread use, the online tool could become an important resource for fisheries biologists. La sociedad Americana de Pesquerías (AFS) publicó recientemente el libro Métodos estandarizados para el muestreo de peces dulceacuícolas de Norteamérica. Este texto acopia la experiencia de 284 científicos pertenecientes a 107 organizaciones que van desde Canadá hasta México y los Estados Unidos de Norteamérica, y fue desarrollado para facilitar comparaciones de datos sobre peces entre regiones y épocas. Aquí se describe una herramienta amigable que funciona en línea y sirve para automatizar comparaciones entre muestras de la condición de los peces, distribuciones de frecuencia de tallas y captura por unidad de esfuerzo (CPUE) obtenidos mediante métodos estándar de la AFS. Actualmente, esta herramienta (1) proporciona instantáneamente resúmenes de casi 4,000 sets de datos de condición corporal, frecuencia de tallas y CPUE de los peces dulceacuícolas más comunes, colectados mediante artes estandarizadas en 43 estados y provincias; (2) se puede fácilmente agregar información y nuevos datos de campo estandarizados, con el fin de actualizar requisitos y sumarios; (3) compara datos sobre peces en un cuerpo de agua en particular, incluyendo resúmenes por continente, ecoregión y estado; y (4) provee información adicional sobre el muestreo estandarizado de peces de la AFS, incluyendo beneficios, estudios en curso para validación de datos y oportunidad para hacer comentarios sobre métodos particulares. Esta herramienta en la red, programada sobre la base PHP en ambiente Drupal, fue financiada por varias secciones de la AFS, agencias y universidades, y es de acceso gratuito desde el portal de la AFS y de fisheriesstandardsampling.org. De uso ampliamente difundido, esta herramienta en línea pudiera convertirse en una fuente importante de información para biólogos pesqueros. La Société américaine des pêches (AFS) a récemment publié des méthodes normalisées d'échantillonnage pour les poissons d'eau douce d'Amérique du Nord. Compilant l'expertise de 284 scientifiques de 107 organisations au Canada, au Mexique et aux États-Unis, ce texte a été élaboré pour faciliter les comparaisons de données sur les poissons dans différentes régions ou sur différentes périodes. Nous décrivons ici un outil Web convivial qui automatise les comparaisons entre échantillons selon l'état de chaque poisson, les distributions des tailles des populations, et la prise par unité d'effort recueillies à l'aide des méthodes normalisées AFS. Actuellement, l'outil Web (1) fournit des résumés instantanés de près de 4000 jeux de données relatives à l'état, à la distribution des tailles, et aux prises par unité d'effort de poissons d'eau douce communs, recueillies à l'aide d'équipements standards dans 43 États et provinces; (2) accepte facilement de nouvelles données de terrain standardisées pour mettre à jour des requêtes et des résumés ultérieurs; (3) compare les données sur les poissons d'un plan d'eau particulier avec celles résumées, d'un continent ou d'une écorégion, ainsi qu'avec les données publiques; et (4) fournit des informations supplémentaires à propos de l'échantillonnage de poissons standard d'AFS, y compris les avantages, les études de validation en cours, et la possibilité de commenter des méthodes spécifiques. L'outil Web programmé selon une architecture logicielle Drupal PHP — a été soutenu par plusieurs sections AFS, organismes et universités et est disponible gratuitement depuis le site AFS et sur fisheriesstandardsampling.org. Gageons que son utilisation répandue pourra en faire un outil de référence pour les biologistes de la pêche.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesInsufficient payload (model declined to judge)
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Not applicable · Consensus signal: Not applicable
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.445
Threshold uncertainty score0.996

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.001
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0040.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.090
GPT teacher head0.331
Teacher spread0.241 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

Study designNot applicable
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations5
Published2015
Admission routes2
Has abstractyes

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