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Record W2214093771 · doi:10.82308/49534

Alteration of macrophage signalling and functions by the protozoan parasite «Leishmania»

2009· dissertation· en· W2214093771 on OpenAlexfundno aff
Issa Abu Dayyeh

Bibliographic record

VenueeScholarship@McGill (McGill) · 2009
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicResearch on Leishmaniasis Studies
Canadian institutionsnot available
FundersCanadian Institutes of Health Research
KeywordsBiologyCell biologyKinaseProtein tyrosine phosphataseLeishmaniaImmune systemTyrosine kinaseSignal transductionImmunologyParasite hosting

Abstract

fetched live from OpenAlex

Les parasites du genre Leishmania assurent leur survie et leur propagation par l'altération de voies de signalisation impliquées dans la capacité des macrophages (MØs) à détruire directement les pathogènes ou à activer les cellules du système immunitaire acquis. Une étape critique de ce mécanisme d'inactivation est l'activation par Leishmania de la protéine phosphatase SHP-1 de la cellule hôte. Il a été démontré que la protéine SHP-1 peut inactiver directement JAK2 ainsi que Erk1/2 et joue un rôle dans la régulation négative de plusieurs facteurs de transcription, tels que NF-κB, STAT-1α et AP-1, impliqués dans l'activation des MØs. L'altération de ces voies de signalisation contribue à l'inactivation de fonctions critiques des MØs telle que la production d'oxyde nitrique (NO) induite par l'IFN-γ, un radical-libre impliqué dans l'anéantissement du parasite. En plus d'inhiber les fonctions engendrées par l'IFN-γ, Leishmania est capable d'inhiber de nombreuses fonctions induites par le LPS, incluant la production d'IL-12, de TNF-α et de NO, et cela par des mécanismes encore peu compris. Le but principal de cette étude était de mieux comprendre les stratégies employées par le parasite afin d'inhiber les fonctions induites par les Toll-like receptors (TLRs). Nos résultats révèlent le rôle critique de SHP-1 dans l'inhibition de l'activation des MØs induite par les TLRs, par l'interaction et l'inactivation de la kinase 1 associée au récepteur IL-1 (IRAK-1). Nous avons également identifié le site de liaison qui semble être un motif conservé lors de l'évolution ressemblant à un ITIM, que nous avons nommé motif de kinase à base de tyrosine inhibiteur (KTIM). Des expériences supplémentaires et l'analyse de séquences ont révélées que plusieurs autres kinases cytosoliques autres qu'IRAK-1 possèdent un motif potentiel KTIMs, suggérant que le KTIM pourrait$

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.001
Threshold uncertainty score0.004

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.020
GPT teacher head0.285
Teacher spread0.265 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2009
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