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Record W2238114004 · doi:10.82308/27379

Somatic cell nuclear transfer and the production of transgenic large animals: the effects of ER stress on porcine embryonic development

2014· article· en· W2238114004 on OpenAlexfundno aff
Naomi Dicks

Bibliographic record

VenueeScholarship@McGill (McGill) · 2014
Typearticle
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicAnimal Genetics and Reproduction
Canadian institutionsnot available
FundersUniversity of AlbertaMcGill University
KeywordsBiologySomatic cell nuclear transferCell biologyEmbryonic stem cellTransgeneSomatic cellUnfolded protein responseEmbryoTransfectionStem cellMolecular biologyEmbryogenesisCell cultureGeneticsBlastocystGeneEndoplasmic reticulum

Abstract

fetched live from OpenAlex

Les grands animaux transgéniques ont plusieurs applications incluant des modèles biomédicaux, xénotransplantation, production des pharmaceutiques, médecine régénératrice, et l’amélioration du bétail. Plusieurs méthodes pour créer des rongeurs transgéniques ne sont pas pratiques pour créer des grands animaux transgéniques. Le transfert nucléaire de cellules somatiques est une méthode courante pour la production des grands animaux transgéniques, malgré que son efficacité de clonage est très faible. Ceci est attribué à une reprogrammation épigénétique aberrante, mais une autre cause pourrait être le stress du RE. L’objectif de cette étude était d’investiguer le rôle du stress du RE dans le développement des embryons clonés porcins. Le stress du RE a été créé en réduisant l’expression de calnexin, un gène important dans le maintien de l’homéostase du RE. Le stress du RE a été soulagé en traitant des embryons à clivage rapide et clivage lente avec un inhibiteur de stress du RE, ATUDC, et évaluer leur développement par la suite.Pour évaluer le développement des embryons clonés déficient ou manquant de calnexin, les technologies interférence par ARN et des nucléases effectrices TAL ont été utilisées, respectivement. La réduction de la protéine calnexin était marginale dans les cellules survivantes, ce qui suggérait que la viabilité cellulaire était réduit. La reconstruction d’embryons en utilisant des cellules transfectées avec un shARN ciblé contre le calnexin a démontré une diminution de développement dans les embryons qui exprimaient le marqueur de fluorescence co-transfecté. Ces résultats suggéraient un rôle indispensable pour le gène calnexin dans la viabilité cellulaire et le développement embryonnaire porcin. Des embryons activés parthénogénétiquement ont été utilisés pour évaluer l’impact du stress du RE dans le développement des embryons à clivage rapide et lente, en les traitant avec ou sans ATUDC. La proportion des embryons qui développait au stade de blastocyste était élevée de façon significative dans les embryons à clivage rapide et lente traités avec ATUDC. De la même façon, les embryons à clivage rapide et lente traités avec ATUDC démontraient une qualité supérieure, selon le nombre augmenté de blastomères. Il est intéressant de noter que la qualité des embryons à clivage lente traités avec ATUDC dépassait celle des embryons à clivage rapide non-traités.Ces résultats impliquent que l’homéostase du RE est un facteur important dans le développement embryonnaire porcin. Parce que les embryons clonés souffrent du stress du RE, il est important de comprendre les mécanismes qui maintiennent l’homéostase du RE dans le développement. Cette information peut nous aider à améliorer l’efficacité du clonage et faciliter la production des grands animaux transgéniques.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.002
Threshold uncertainty score0.007

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.001
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.005
GPT teacher head0.192
Teacher spread0.187 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2014
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