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Record W2264555042

Caractérisation générique des perchaudes (Perca flavescens) du Lac Saint-Pierre avec l'espaceur intergénique (IGS) de l'ADN ribosomal et sa relation avec la croissance

2015· article· fr· W2264555042 on OpenAlexaboutno aff
Frédérique Bélanger-Lépine

Bibliographic record

VenueLe dépôt institutionnel (Université du Québec à Trois-Rivières) · 2015
Typearticle
Languagefr
FieldEnvironmental Science
TopicFish Ecology and Management Studies
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsHumanitiesMolecular biologyBiologyPhysicsPhilosophy
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

L'espaceur intergenique (IGS) de l'ADN ribosomal est associe a la transcription des genes d'ARNr. Chez les invertebres, l'heterogeneite de la longueur de l'IGS causee par la variation du nombre de copies d'elements de regulation serait liee a la croissance des organismes. Une etude anterieure effectuee sur l'IGS de la perchaude (Perca flavescens) au lac Saint-Pierre (LSP), a revele la presence de deux alleles qui different par 1 kb due a la variation du nombre d'unites de repetition. Ceci fournit une occasion unique d'evaluer si cette heterogeneite au niveau de la longueur de l'IGS est associee a la selection et pourrait s'exercer dans les populations naturelles. L'objectif de cette etude etait double. Le premier objectif etait de determiner si ces alleles sont soumis a une selection genotypique tout en regardant, si la selection s'exerce, ce qui se passe au niveau spatial et ontogenique. Le deuxieme objectif etait de determiner si la longueur de l'IGS est liee a la croissance des individus, comme ce qui a ete observe chez les invertebres. Ce projet a ete realise sur 353 perchaudes provenant de cinq populations naturelles differentes, soit celle du LSP ainsi que celles provenant de quatre autres lacs se trouvant a la limite du Bouclier canadien et des Basses terres du Saint-Laurent. Les resultats n'ont revele aucun exces d'heterozygote par rapport a un modele de neutralite et il n'y avait aucune relation significative entre la longueur des IGS et la croissance a court terme des organismes. De plus, aucune selection ne s'effectuait au niveau spatial et ontogenique. Par contre, les deux alleles (4 et 22) etaient toujours presents et dans les memes frequences entre les populations echantillonnees. La valeur du Fst effectue sur l'IGS pour quantifier la differenciation genetique entre les differentes populations de perchaudes n'etait pas significativement differente de zero, contrairement a la valeur du FST effectue a partir des marqueurs neutres, les microsatellites (p = 0,1665). Ces resultats suggerent qu'il s'agit d'un premier cas de selection balancee qui agit sur une region regulatrice plutot que sur une region codante. Par ailleurs, il s'agit d'une premiere demonstration de selection balancee dans des populations naturelles et qui agit sur une region regulatrice, comme l'IGS.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.988
Threshold uncertainty score0.024

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.014
GPT teacher head0.206
Teacher spread0.193 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Published2015
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