MétaCan
Menu
Back to cohort
Record W2316864173 · doi:10.1055/s-0034-1388343

BRCA1-abhängige Expression des „Receptor for Hyaluron Mediated Motility“ (RHAMM) in Mammakarzinomen

2014· article· de· W2316864173 on OpenAlexaff
H Baumbach, Johanna Naskou, Yeming Yang, Dieter Niederacher, Christopher A. Maxwell, Tanja Fehm, M Fleisch, Ellen Honisch

Bibliographic record

VenueGeburtshilfe und Frauenheilkunde · 2014
Typearticle
Languagede
FieldMedicine
TopicPeptidase Inhibition and Analysis
Canadian institutionsChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Fundersnot available
KeywordsMotilityReceptorIntracellularMolecular biologyChemistryCell biologyBiologyBiochemistry

Abstract

fetched live from OpenAlex

Hintergrund: RHAMM (Receptor for Hyaluron Mediated Motility, intracellular hyaluronan binding protein [IHAP], CD168) ist als Brustkrebs -Risikofaktor identifiziert, der das Erkrankungsrisiko von BRCA1Mutationsträgerinnen modifiziert (Maxwell et al., 2012). Die Überexpression von RHAMM ist mit einer schlechten Prognose assoziiert. BRCA1 reguliert RHAMM direkt, indem es im Verlauf des Zellzyklus über eine Ubiquitinylierung die Degradation von RHAMM einleitet. Methodik: Die maligne Zelllinie HCC1937 und die nicht-maligne Zelllinie MCF12a dienen als Modellsysteme. HCC1937-Zellen sind homozygot für die inaktivierende BRCA1 Mutation c.5385dupC und damit BCRA1 Null-(ko-)Mutanten. Zur Komplementation des BRCA1 ko-Phänotyps werden HCC1937 Zellen mit BRCA1 wild-type und BRCA1delEx11 Konstrukten mittels viraler Vektoren transfiziert. In MCF12a Zellen mit intaktem funktionsfähigem BRCA1 wurde mittels viraler Transfektion von BRCA1-shRNAs ein konstitutiver knockdown von BRCA1 erreicht. In Westernblots wurde die Expression von BRCA1 und RHAMM auf Proteinebene analysiert. Mittels quantitativer PCR mit reverser Transkriptase wurde der mRNA-Gehalt von BRCA1 und RHAMM beobachtet. Ergebnisse: Die HCC1937-Zellen, die nativ kein BRCA1 exprimieren, zeigen nach der Transfektion über virale Vektoren eine erhöhte BRCA1-Expression. Beide Konstrukte, WT-BRCA1 und BRCA1delEx11, zeigen einen Anstieg von BRCA1 auf transkriptioneller wie auch auf translationaler Ebene. Die RHAMM- mRNA ist in nativen HCC1937-Zellen überexprimiert. Das mRNA-Level RHAMMs sinkt in Anwesenheit der eingeschleusten Konstrukte. Auf translationaler Ebene kann in den HCC1937 nach Transfektion von WT-BRCA1 eine Verringerung des RHAMM-Proteingehalts beobachtete werden nicht jedoch nach Transfektion der BRCA1delEx11-Variante. In MCF12a-Zellen zeigten nach viraler Transfektion verschiedene BRCA1-shRNA Konstrukte unterschiedlich starken BRCA1-Knockdown. Schlussfolgerung: BRCA1 reduziert die RHAMM-Expression auf Proteinebene über Ubiquitinylierung und ist ein negativer Regulator der RHAMM Transkription.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.012

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0040.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.022
GPT teacher head0.281
Teacher spread0.259 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2014
Admission routes1
Has abstractyes

Explore more

Same venueGeburtshilfe und FrauenheilkundeSame topicPeptidase Inhibition and AnalysisFrench-language works237,207